Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 TOF2YKR010C 2316 nt1.64□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 PEX8YGR077C 1770 nt1.64□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 REV3YPL167C 4515 nt1.64□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 YDR008CYDR008C 351 nt1.63□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.63□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 NBL1YHR199C-A 222 nt1.63□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 ZRG17YNR039C 1818 nt1.63□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 MAK10YEL053C 2202 nt1.63□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 YLR171WYLR171W 390 nt1.62□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 HHT1YBR010W 411 nt1.62□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 YOR392WYOR392W 444 nt1.62□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 KAP122YGL016W 3246 nt1.62□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 IRA1YBR140C 9279 nt1.61□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 FIG2YCR089W 4830 nt1.61□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 URM1YIL008W 300 nt1.61□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 YJL022WYJL022W 309 nt1.61□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 NFU1YKL040C 771 nt1.61□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 BST1YFL025C 3090 nt1.61□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 SFB2YNL049C 2631 nt1.61□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 BRR2YER172C 6492 nt1.61□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 SSK2YNR031C 4740 nt1.6□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 snR54snR54 86 nt1.6□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 YBP1YBR216C 2025 nt1.6□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 SPC110YDR356W 2835 nt1.6□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 ALK1YGL021W 2283 nt1.6□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 SXM1YDR395W 2835 nt1.59□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 SWI5YDR146C 2130 nt1.59□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 ATP19YOL077W-A 207 nt1.59□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 YGL239CYGL239C 315 nt1.58□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.58□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 NCA2YPR155C 1851 nt1.57□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 ECL1YGR146C 636 nt1.57□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 EMC5YIL027C 426 nt1.57□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 COF1YLL050C 432 nt1.57□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 VPS55YJR044C 423 nt1.56□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 CDC33YOL139C 642 nt1.56□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 PET127YOR017W 2403 nt1.55□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.55□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.55□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.55□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 GAL7YBR018C 1101 nt1.55□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 Q0017Q0017 162 nt1.55□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.55□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 CCH1YGR217W 6120 nt1.55□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 POL5YEL055C 3069 nt1.55□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 DCP2YNL118C 2913 nt1.54□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 YLR140WYLR140W 327 nt1.54□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 RUF22RUF22 515 nt1.54□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 RPL32YBL092W 393 nt1.54□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 ZEO1YOL109W 342 nt1.54□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 YOP1YPR028W 543 nt1.54□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 CFT1YDR301W 4074 nt1.54□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 DGR2YKL121W 2559 nt1.53□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 RPL40BYKR094C 387 nt1.53□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 TOM22YNL131W 459 nt1.53□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 FYV12YOR183W 390 nt1.53□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 YPL182CYPL182C 384 nt1.53□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 SPO23YBR250W 1572 nt1.53□□□□□ -2.16
CIK1Q01649 FYV8YGR196C 2454 nt1.52□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 MLH3YPL164C 2148 nt1.52□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 ANS1YHR126C 480 nt1.52□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.52□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 ERP4YOR016C 624 nt1.52□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 PMD1YER132C 5262 nt1.52□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 UFD2YDL190C 2886 nt1.52□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 ZIP1YDR285W 2628 nt1.52□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 MVP1YMR004W 1536 nt1.51□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 TRM732YMR259C 4263 nt1.51□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 CHS1YNL192W 3396 nt1.51□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 EST2YLR318W 2655 nt1.51□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.51□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 HIT1YJR055W 495 nt1.51□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 snR41snR41 95 nt1.51□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 PXA2YKL188C 2562 nt1.51□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 MKT1YNL085W 2493 nt1.5□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 LYS14YDR034C 2373 nt1.5□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.5□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YLR101CYLR101C 396 nt1.5□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.5□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 SMC4YLR086W 4257 nt1.49□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 PAU2YEL049W 363 nt1.49□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.49□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YOR376WYOR376W 369 nt1.49□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 HKR1YDR420W 5409 nt1.49□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 SRP14YDL092W 441 nt1.48□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YDR114CYDR114C 303 nt1.48□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YLR456WYLR456W 615 nt1.48□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YOR146WYOR146W 306 nt1.48□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YCS4YLR272C 3531 nt1.48□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 MEC1YBR136W 7107 nt1.47□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 RTR1YER139C 681 nt1.47□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YJL015CYJL015C 285 nt1.47□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 PHS1YJL097W 654 nt1.47□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YBL071CYBL071C 309 nt1.47□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.47□□□□□ -2.17
CIK1Q01649 TIM18YOR297C 579 nt1.46□□□□□ -2.18
CIK1Q01649 MSN5YDR335W 3675 nt1.46□□□□□ -2.18
CIK1Q01649 KIP1YBL063W 3336 nt1.45□□□□□ -2.18
CIK1Q01649 RAD50YNL250W 3939 nt1.45□□□□□ -2.18
CIK1Q01649 SWI6YLR182W 2412 nt1.45□□□□□ -2.18
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