Protein–RNA interactions for Protein: P43608

YFR035C, Uncharacterized protein YFR035C, yeastyeast

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR035CP43608 NBP1YLR457C 960 nt0.36□□□□□ -2.35
YFR035CP43608 ATG16YMR159C 453 nt0.36□□□□□ -2.35
YFR035CP43608 YCL046WYCL046W 324 nt0.36□□□□□ -2.35
YFR035CP43608 PSF2YJL072C 642 nt0.35□□□□□ -2.35
YFR035CP43608 YMR321CYMR321C 318 nt0.35□□□□□ -2.35
YFR035CP43608 SVS1YPL163C 783 nt0.35□□□□□ -2.35
YFR035CP43608 snR34snR34 203 nt0.35□□□□□ -2.35
YFR035CP43608 snR44snR44 211 nt0.35□□□□□ -2.35
YFR035CP43608 GEA2YEL022W 4380 nt0.35□□□□□ -2.35
YFR035CP43608 SGD1YLR336C 2700 nt0.35□□□□□ -2.35
YFR035CP43608 YDL206WYDL206W 2289 nt0.34□□□□□ -2.35
YFR035CP43608 NTF2YER009W 378 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 CHZ1YER030W 462 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YGR045CYGR045C 363 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 RPL42BYHR141C 321 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 BMT5YIL096C 1011 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YMR324CYMR324C 243 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 RPL42AYNL162W 321 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 PIG1YLR273C 1947 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YCL020WYCL020W 1317 nt0.34□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 RSM18YER050C 417 nt0.33□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 SVP26YHR181W 687 nt0.33□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 UBX4YMR067C 1251 nt0.33□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 NUT2YPR168W 474 nt0.33□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 MPT5YGL178W 2580 nt0.33□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 PXA2YKL188C 2562 nt0.33□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YBR184WYBR184W 1572 nt0.32□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 RPL29YFR032C-A 180 nt0.32□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 ECM12YHR021W-A 456 nt0.32□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YOR366WYOR366W 354 nt0.32□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.32□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 KAR3YPR141C 2190 nt0.32□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 NUP120YKL057C 3114 nt0.31□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 SRP14YDL092W 441 nt0.31□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YDL196WYDL196W 330 nt0.31□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 SWF1YDR126W 1011 nt0.31□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 ATC1YDR184C 885 nt0.31□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 VPS74YDR372C 1038 nt0.31□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YIL059CYIL059C 366 nt0.31□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YBR032WYBR032W 303 nt0.31□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 SLM6YBR266C 453 nt0.31□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 REF2YDR195W 1602 nt0.31□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 AIM44YPL158C 2277 nt0.3□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 LYS14YDR034C 2373 nt0.3□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 RMD6YEL072W 696 nt0.3□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YGL042CYGL042C 306 nt0.3□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 RPS7BYNL096C 573 nt0.3□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 IES4YOR189W 351 nt0.3□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 NOC3YLR002C 1992 nt0.29□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 IES5YER092W 378 nt0.29□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YJL086CYJL086C 369 nt0.29□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 GPX1YKL026C 504 nt0.29□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YOR199WYOR199W 330 nt0.29□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 NUP82YJL061W 2142 nt0.29□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 PAN2YGL094C 3348 nt0.28□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 RUB1YDR139C 234 nt0.28□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.28□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 TIM8YJR135W-A 264 nt0.28□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 VPS63YLR261C 327 nt0.28□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 UFE1YOR075W 1041 nt0.28□□□□□ -2.36
YFR035CP43608 BUL2YML111W 2763 nt0.28□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YDL068WYDL068W 330 nt0.27□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 ALG13YGL047W 609 nt0.27□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.27□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 SAG1YJR004C 1953 nt0.26□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 STO1YMR125W 2586 nt0.26□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.26□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 SUS1YBR111W-A 291 nt0.26□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 ZIP1YDR285W 2628 nt0.26□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YPR172WYPR172W 603 nt0.25□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 HDA3YPR179C 1968 nt0.25□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.24□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YSP1YHR155W 3687 nt0.24□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YDR509WYDR509W 348 nt0.24□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 TAD1YGL243W 1203 nt0.24□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 GIM5YML094W 492 nt0.24□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt0.24□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt0.24□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.23□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 SWI5YDR146C 2130 nt0.23□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.23□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.23□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.23□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YOP1YPR028W 543 nt0.23□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 SCW11YGL028C 1629 nt0.23□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 HNT1YDL125C 477 nt0.22□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 YGR290WYGR290W 444 nt0.22□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 DFG10YIL049W 762 nt0.22□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 ARV1YLR242C 966 nt0.22□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 SPC2YML055W 537 nt0.22□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 RUF22RUF22 515 nt0.22□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 DBP6YNR038W 1890 nt0.22□□□□□ -2.37
YFR035CP43608 VPS52YDR484W 1926 nt0.21□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.4 ms