Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 ISF1YMR081C 1017 nt1.99□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YDR341CYDR341C 1824 nt1.98□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.98□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 PGA1YNL158W 597 nt1.98□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 HCH1YNL281W 462 nt1.98□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 AIM9YER080W 1884 nt1.98□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 CHC1YGL206C 4962 nt1.98□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 SSQ1YLR369W 1974 nt1.98□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 ZRG8YER033C 3231 nt1.97□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 RPS20YHL015W 366 nt1.97□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 RPA34YJL148W 702 nt1.97□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YKL083WYKL083W 615 nt1.97□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 RPS27AYKL156W 249 nt1.97□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YML003WYML003W 873 nt1.97□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 RPL32YBL092W 393 nt1.97□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 GCN2YDR283C 4980 nt1.97□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YJR098CYJR098C 1971 nt1.96□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YCR043CYCR043C 384 nt1.96□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 RPL42BYHR141C 321 nt1.96□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 PHS1YJL097W 654 nt1.96□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 RPL42AYNL162W 321 nt1.96□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.96□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 SYH1YPL105C 2550 nt1.96□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 USO1YDL058W 5373 nt1.95□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 RPL37BYDR500C 267 nt1.95□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.95□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YAR053WYAR053W 297 nt1.95□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 PDR8YLR266C 2106 nt1.95□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 CYB5YNL111C 363 nt1.95□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YPL229WYPL229W 621 nt1.95□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 CAT2YML042W 2013 nt1.95□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 DFG16YOR030W 1860 nt1.94□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.94□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YNL114CYNL114C 372 nt1.94□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 NAM7YMR080C 2916 nt1.94□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.93□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 CGI121YML036W 546 nt1.93□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YBL073WYBL073W 312 nt1.93□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 IRC23YOR044W 474 nt1.93□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 UBP1YDL122W 2430 nt1.93□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 PET309YLR067C 2898 nt1.93□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 RPH1YER169W 2391 nt1.93□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 HER1YOR227W 3741 nt1.93□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 FAB1YFR019W 6837 nt1.93□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 GUP1YGL084C 1683 nt1.93□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 PEX8YGR077C 1770 nt1.93□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 PLC1YPL268W 2610 nt1.92□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.92□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YDR008CYDR008C 351 nt1.92□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.92□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 BIL1YOR304C-A 231 nt1.92□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YCL023CYCL023C 348 nt1.92□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.92□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 IRR1YIL026C 3453 nt1.92□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.91□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.91□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 VPS34YLR240W 2628 nt1.91□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 MGA2YIR033W 3342 nt1.91□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 RTP1YMR185W 2946 nt1.9□□□□□ -2.1
YBL055CP34220 CFT2YLR115W 2580 nt1.9□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 ARP7YPR034W 1434 nt1.9□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 AGC1YPR021C 2709 nt1.89□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.89□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 PRE4YFR050C 801 nt1.89□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 TMA7YLR262C-A 195 nt1.89□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 HHT1YBR010W 411 nt1.89□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 TDA9YML081W 3756 nt1.88□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.88□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.88□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 SWI5YDR146C 2130 nt1.87□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 YIL059CYIL059C 366 nt1.87□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.87□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 HCS1YKL017C 2052 nt1.87□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 UBR2YLR024C 5619 nt1.87□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 PEP1YBL017C 4740 nt1.87□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 OSH6YKR003W 1347 nt1.87□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 TFC8YPL007C 1767 nt1.86□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 YHL041WYHL041W 450 nt1.86□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 MRPL31YKL138C 396 nt1.86□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 FMP23YBR047W 528 nt1.86□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 PAC1YOR269W 1485 nt1.86□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 PXA2YKL188C 2562 nt1.86□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 HDA3YPR179C 1968 nt1.85□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 ATG11YPR049C 3537 nt1.85□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.85□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 MCM22YJR135C 720 nt1.85□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 RPL40BYKR094C 387 nt1.85□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 PAU18YLL064C 363 nt1.85□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 PAU6YNR076W 363 nt1.85□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.85□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 YPL225WYPL225W 441 nt1.85□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 YCL046WYCL046W 324 nt1.85□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 YMR045CYMR045C 5268 nt1.84□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 EFR3YMR212C 2349 nt1.84□□□□□ -2.11
YBL055CP34220 SGO1YOR073W 1773 nt1.84□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 LRE1YCL051W 1752 nt1.84□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 NOP53YPL146C 1368 nt1.84□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 SWI6YLR182W 2412 nt1.83□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 YAF9YNL107W 681 nt1.83□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 TIM18YOR297C 579 nt1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.2 ms