Protein–RNA interactions for Protein: P0CX21

YRF1-5, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-5P0CX21 KEG1YFR042W 603 nt0.15□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.15□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 RPS24BYIL069C 408 nt0.15□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 VPS74YDR372C 1038 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 IST3YIR005W 447 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 FAR3YMR052W 615 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YOL050CYOL050C 321 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YBR051WYBR051W 351 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 NOT5YPR072W 1683 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YJL032WYJL032W 315 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 ATP18YML081C-A 180 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 ABF2YMR072W 552 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 DDR48YMR173W 1293 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YDR199WYDR199W 366 nt0.13□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 RSM27YGR215W 333 nt0.13□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.13□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YOR282WYOR282W 321 nt0.13□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 PIG1YLR273C 1947 nt0.13□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 MLP1YKR095W 5628 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 HYM1YKL189W 1200 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 AIM44YPL158C 2277 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 CHZ1YER030W 462 nt0.11□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YLR042CYLR042C 486 nt0.11□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YBR062CYBR062C 543 nt0.11□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.11□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 RPL32YBL092W 393 nt0.11□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YCL020WYCL020W 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 NOC3YLR002C 1992 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 GPI2YPL076W 843 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YDL009CYDL009C 324 nt0.09□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YJR071WYJR071W 369 nt0.09□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.09□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 DBP6YNR038W 1890 nt0.09□□□□□ -2.39
YRF1-5P0CX21 SAG1YJR004C 1953 nt0.09□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 YJL007CYJL007C 315 nt0.09□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 CCE1YKL011C 1062 nt0.09□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 VPS52YDR484W 1926 nt0.09□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 SLM6YBR266C 453 nt0.08□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 DPB11YJL090C 2295 nt0.08□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 SWM2YNR004W 441 nt0.07□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 STO1YMR125W 2586 nt0.07□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 SLI15YBR156C 2097 nt0.07□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 ALG13YGL047W 609 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 RAD6YGL058W 519 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 GOS1YHL031C 672 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 LOA1YPR139C 903 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 YGR265WYGR265W 411 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 BET4YJL031C 984 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 YKL115CYKL115C 393 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 SPR2YOR214C 711 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 VIK1YPL253C 1944 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 IMP3YHR148W 552 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 SCW11YGL028C 1629 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 YDR290WYDR290W 330 nt0.04□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 YOR199WYOR199W 330 nt0.04□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 NPR2YEL062W 1848 nt0.04□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 AFR1YDR085C 1863 nt0.04□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 MKT1YNL085W 2493 nt0.04□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 ISD11YER048W-A 285 nt0.04□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 GEP7YGL057C 864 nt0.04□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 CRG1YHR209W 876 nt0.04□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.03□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 SDH2YLL041C 801 nt0.03□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 RTC6YPL183W-A 282 nt0.03□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 ROX1YPR065W 1107 nt0.03□□□□□ -2.4
YRF1-5P0CX21 PDE2YOR360C 1581 nt0.02□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 RUF22RUF22 515 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 YOR105WYOR105W 327 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 BFR2YDR299W 1605 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 RFA3YJL173C 369 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 PHO80YOL001W 882 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 BI3Q0115 1554 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 MET32YDR253C 576 nt0□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 YEL010WYEL010W 351 nt0□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 RPS16AYMR143W 432 nt0□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt-0.01□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt-0.01□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 SWI5YDR146C 2130 nt-0.01□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 SMD2YLR275W 333 nt-0.01□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 CHS6YJL099W 2241 nt-0.02□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 RPL42BYHR141C 321 nt-0.02□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 RPL42AYNL162W 321 nt-0.02□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 LSM4YER112W 564 nt-0.03□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 YPR172WYPR172W 603 nt-0.03□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 KAR3YPR141C 2190 nt-0.03□□□□□ -2.41
YRF1-5P0CX21 RPL35AYDL191W 363 nt-0.04□□□□□ -2.42
YRF1-5P0CX21 RTR2YDR066C 591 nt-0.04□□□□□ -2.42
YRF1-5P0CX21 YLR232WYLR232W 348 nt-0.04□□□□□ -2.42
YRF1-5P0CX21 YGR164WYGR164W 336 nt-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 141.4 ms