Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMCO3A2RU48 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms