Protein–RNA interactions for Protein: Q12116

TMS1, Membrane protein TMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMS1Q12116 PRK1YIL095W 2433 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 RGA1YOR127W 3024 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 RAV1YJR033C 4074 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 LSO2YGR169C-A 279 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 MSL1YIR009W 336 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 ABM1YJR108W 372 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 MRPL31YKL138C 396 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 YAR053WYAR053W 297 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 RPS18BYML026C 441 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 YMR324CYMR324C 243 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 RPL9BYNL067W 576 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 BIL1YOR304C-A 231 nt1.98□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 MCD1YDL003W 1701 nt1.97□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 CLN3YAL040C 1743 nt1.97□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 PTC5YOR090C 1719 nt1.97□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 PCF11YDR228C 1881 nt1.97□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 YKL118WYKL118W 312 nt1.97□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 PGA1YNL158W 597 nt1.97□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 YBR277CYBR277C 402 nt1.97□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 UBP11YKR098C 2154 nt1.97□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 SPP41YDR464W 4308 nt1.97□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 SSD1YDR293C 3753 nt1.97□□□□□ -2.09
TMS1Q12116 REV1YOR346W 2958 nt1.96□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 GCN4YEL009C 846 nt1.96□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 TMA22YJR014W 597 nt1.96□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 RPS17AYML024W 411 nt1.96□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YAF9YNL107W 681 nt1.96□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 DGR1YNL130C-A 147 nt1.96□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 ROX1YPR065W 1107 nt1.96□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 KAR3YPR141C 2190 nt1.96□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 SCH9YHR205W 2475 nt1.96□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 COS111YBR203W 2775 nt1.96□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 NCL1YBL024W 2055 nt1.95□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 UTP22YGR090W 3714 nt1.95□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 CDC50YCR094W 1176 nt1.95□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 FMP16YDR070C 282 nt1.95□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 SHE2YKL130C 741 nt1.95□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 USO1YDL058W 5373 nt1.95□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 CDC24YAL041W 2565 nt1.94□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YDL152WYDL152W 366 nt1.94□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 NHP2YDL208W 471 nt1.94□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 FCF2YLR051C 654 nt1.94□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 LSM7YNL147W 348 nt1.94□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 IRC23YOR044W 474 nt1.94□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 GYP5YPL249C 2685 nt1.94□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 IST2YBR086C 2841 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 DAD4YDR320C-A 219 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YDR413CYDR413C 576 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YER121WYER121W 345 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YER181CYER181C 324 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 RPL26AYLR344W 384 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 RTC6YPL183W-A 282 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 SWT1YOR166C 1377 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 MPH1YIR002C 2982 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 IPT1YDR072C 1584 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 ALK2YBL009W 2031 nt1.93□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 SOK2YMR016C 2358 nt1.92□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YDL011CYDL011C 324 nt1.92□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YHL037CYHL037C 402 nt1.92□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 TIM18YOR297C 579 nt1.92□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 ELG1YOR144C 2376 nt1.92□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 MET18YIL128W 3099 nt1.91□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.91□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YKL083WYKL083W 615 nt1.91□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 ISF1YMR081C 1017 nt1.91□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.91□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 YPL182CYPL182C 384 nt1.91□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 RRP6YOR001W 2202 nt1.91□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 TAE2YPL009C 3117 nt1.91□□□□□ -2.1
TMS1Q12116 WIP1YDR374W-A 270 nt1.9□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YGL024WYGL024W 336 nt1.9□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 GRX8YLR364W 330 nt1.9□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 BFA1YJR053W 1725 nt1.9□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 UFD4YKL010C 4452 nt1.9□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 TOR2YKL203C 7425 nt1.9□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 RTT107YHR154W 3213 nt1.89□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 SGD1YLR336C 2700 nt1.89□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.89□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 MAM33YIL070C 801 nt1.89□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 HCH1YNL281W 462 nt1.89□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 snR36snR36 182 nt1.89□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 DOT6YER088C 2013 nt1.89□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 UBP2YOR124C 3819 nt1.89□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 GIP3YPL137C 3831 nt1.89□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 UBR1YGR184C 5853 nt1.88□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YDR102CYDR102C 333 nt1.88□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 QCR7YDR529C 384 nt1.88□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YER097WYER097W 330 nt1.88□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 NOP10YHR072W-A 177 nt1.88□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.88□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YFR016CYFR016C 3702 nt1.88□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YFL032WYFL032W 321 nt1.87□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YGL239CYGL239C 315 nt1.87□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 TIM13YGR181W 318 nt1.87□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.5 ms