Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 RPL40BYKR094C 387 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 SMD3YLR147C 306 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YNL235CYNL235C 432 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 TTI1YKL033W 3117 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 IML1YJR138W 4755 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 MDM32YOR147W 1869 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 IES5YER092W 378 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YFR057WYFR057W 456 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 CWC23YGL128C 852 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 CRG1YHR209W 876 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 SPC1YJR010C-A 285 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 HCH1YNL281W 462 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 TIM18YOR297C 579 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 SWT1YOR166C 1377 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 SMC1YFL008W 3678 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 SAC3YDR159W 3906 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 RAD50YNL250W 3939 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YGL217CYGL217C 342 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YGR265WYGR265W 411 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 RCN1YKL159C 636 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 YLL020CYLL020C 306 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 RPL37AYLR185W 267 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 SPR3YGR059W 1539 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG41Q12048 RRI2YOL117W 1938 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 MAK10YEL053C 2202 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 NUP120YKL057C 3114 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 RSM27YGR215W 333 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YNL150WYNL150W 408 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 ATP20YPR020W 348 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 KAR1YNL188W 1302 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YBR184WYBR184W 1572 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 SLX4YLR135W 2247 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 NST1YNL091W 3723 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 SPC2YML055W 537 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YBL073WYBL073W 312 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YCL046WYCL046W 324 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 SEC3YER008C 4011 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 MRPL32YCR003W 552 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 snR83snR83 306 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 CHZ1YER030W 462 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 RPL42BYHR141C 321 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 MRPS8YMR158W 468 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 RPL42AYNL162W 321 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YLL054CYLL054C 2532 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YPR117WYPR117W 7470 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YML003WYML003W 873 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 RPS18BYML026C 441 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 DDR48YMR173W 1293 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YPR170CYPR170C 336 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 SEF1YBL066C 3447 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 SGO1YOR073W 1773 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YGR130CYGR130C 2451 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 RTR1YER139C 681 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 TAD1YGL243W 1203 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 PAU18YLL064C 363 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 PAU6YNR076W 363 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 snR14snR14 160 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 VPS52YDR484W 1926 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 SWI4YER111C 3282 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 YEL057CYEL057C 702 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 RPL9BYNL067W 576 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 VPS54YDR027C 2670 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG41Q12048 PAU2YEL049W 363 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 MPC1YGL080W 393 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YGL230CYGL230C 444 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YHR054CYHR054C 1065 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 VAM3YOR106W 852 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 CDC39YCR093W 6327 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 ZRG17YNR039C 1818 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 GDS1YOR355W 1569 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YCL020WYCL020W 1317 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 STB6YKL072W 2301 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 DCP2YNL118C 2913 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YGR115CYGR115C 780 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YIR020CYIR020C 303 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YPT6YLR262C 648 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 COX7YMR256C 183 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 snR79snR79 84 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 NHP2YDL208W 471 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 SMB1YER029C 591 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 YPR147CYPR147C 915 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 POP7YBR167C 423 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG41Q12048 SPT21YMR179W 2277 nt0.69□□□□□ -2.3
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