Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 snR14snR14 160 nt0.79□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 PEP3YLR148W 2757 nt0.79□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 YDL073WYDL073W 2955 nt0.78□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 LOC1YFR001W 615 nt0.78□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 ACF4YJR083C 930 nt0.78□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 TIM8YJR135W-A 264 nt0.78□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 OSH6YKR003W 1347 nt0.78□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 SWI4YER111C 3282 nt0.78□□□□□ -2.28
HRD1Q08109 KAP120YPL125W 3099 nt0.77□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 RTR2YDR066C 591 nt0.77□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.77□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YGR265WYGR265W 411 nt0.77□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 RCN1YKL159C 636 nt0.77□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.77□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 CLU1YMR012W 3834 nt0.77□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.77□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 PIP2YOR363C 2991 nt0.77□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YDL068WYDL068W 330 nt0.76□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.76□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YGL217CYGL217C 342 nt0.76□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YPR172WYPR172W 603 nt0.76□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 NUT1YGL151W 3399 nt0.76□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 SGD1YLR336C 2700 nt0.76□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 MDM32YOR147W 1869 nt0.75□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YPR117WYPR117W 7470 nt0.75□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 SAS3YBL052C 2496 nt0.75□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.75□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 APL3YBL037W 3078 nt0.75□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 LSO2YGR169C-A 279 nt0.75□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 POL32YJR043C 1053 nt0.75□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 SLS1YLR139C 1932 nt0.74□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 IES5YER092W 378 nt0.74□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.74□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 ARV1YLR242C 966 nt0.74□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YOR364WYOR364W 369 nt0.74□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YPL080CYPL080C 327 nt0.74□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 PAU24YBR301W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 snR83snR83 306 nt0.73□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 RTT102YGR275W 474 nt0.73□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YHR054CYHR054C 1065 nt0.73□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 DFG10YIL049W 762 nt0.73□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YBL062WYBL062W 381 nt0.73□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 SLX4YLR135W 2247 nt0.73□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 KAR3YPR141C 2190 nt0.73□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YLL054CYLL054C 2532 nt0.72□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 YBL073WYBL073W 312 nt0.72□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 ERP4YOR016C 624 nt0.72□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 SPR2YOR214C 711 nt0.72□□□□□ -2.29
HRD1Q08109 RAD50YNL250W 3939 nt0.71□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.71□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 PAU18YLL064C 363 nt0.71□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 DDR48YMR173W 1293 nt0.71□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.71□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 PAU6YNR076W 363 nt0.71□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 FMP23YBR047W 528 nt0.71□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YCL046WYCL046W 324 nt0.71□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 REF2YDR195W 1602 nt0.71□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 TDA2YER071C 381 nt0.7□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YIR020CYIR020C 303 nt0.7□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YAR009CYAR009C 3591 nt0.69□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 VMA7YGR020C 357 nt0.69□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 IRC23YOR044W 474 nt0.69□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 ATP20YPR020W 348 nt0.69□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 NUP145YGL092W 3954 nt0.69□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 SGO1YOR073W 1773 nt0.68□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 CHZ1YER030W 462 nt0.68□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 CRG1YHR209W 876 nt0.68□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YLR366WYLR366W 306 nt0.68□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 GDS1YOR355W 1569 nt0.67□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.67□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 PAU2YEL049W 363 nt0.67□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.67□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.67□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.67□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YOL106WYOL106W 354 nt0.67□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YPR170CYPR170C 336 nt0.67□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 VPS52YDR484W 1926 nt0.67□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 SPT21YMR179W 2277 nt0.67□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 SNO3YFL060C 669 nt0.66□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 SWS2YNL081C 432 nt0.66□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 SNO2YNL334C 669 nt0.66□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 YBR184WYBR184W 1572 nt0.66□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 NUP157YER105C 4176 nt0.65□□□□□ -2.3
HRD1Q08109 PRM8YGL053W 714 nt0.65□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YGR045CYGR045C 363 nt0.65□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YAP3YHL009C 993 nt0.65□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 NBL1YHR199C-A 222 nt0.65□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 SMD3YLR147C 306 nt0.65□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 RPL9BYNL067W 576 nt0.65□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 SAG1YJR004C 1953 nt0.65□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YDL152WYDL152W 366 nt0.64□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 RSM27YGR215W 333 nt0.64□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 LIN1YHR156C 1023 nt0.64□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YLR217WYLR217W 324 nt0.64□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.64□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 SHE9YDR393W 1371 nt0.64□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 HDA3YPR179C 1968 nt0.64□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 CDC24YAL041W 2565 nt0.64□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 RPL42BYHR141C 321 nt0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.4 ms