Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC24CP53992 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms