Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 SPO22YIL073C 2928 nt2.41□□□□□ -2.02
VFA1P40080 DOT6YER088C 2013 nt2.41□□□□□ -2.02
VFA1P40080 APL5YPL195W 2799 nt2.4□□□□□ -2.02
VFA1P40080 SSD1YDR293C 3753 nt2.4□□□□□ -2.03
VFA1P40080 TIM13YGR181W 318 nt2.4□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YHL037CYHL037C 402 nt2.4□□□□□ -2.03
VFA1P40080 SNC1YAL030W 354 nt2.4□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YKL083WYKL083W 615 nt2.4□□□□□ -2.03
VFA1P40080 RPS29AYLR388W 171 nt2.4□□□□□ -2.03
VFA1P40080 FAR11YNL127W 2862 nt2.4□□□□□ -2.03
VFA1P40080 TOP2YNL088W 4287 nt2.4□□□□□ -2.03
VFA1P40080 VTC3YPL019C 2508 nt2.39□□□□□ -2.03
VFA1P40080 TRS130YMR218C 3309 nt2.39□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YDL152WYDL152W 366 nt2.39□□□□□ -2.03
VFA1P40080 NHP2YDL208W 471 nt2.39□□□□□ -2.03
VFA1P40080 MAM33YIL070C 801 nt2.39□□□□□ -2.03
VFA1P40080 CDC53YDL132W 2448 nt2.39□□□□□ -2.03
VFA1P40080 SWA2YDR320C 2007 nt2.39□□□□□ -2.03
VFA1P40080 RIC1YLR039C 3171 nt2.38□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.38□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.38□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YMR320WYMR320W 306 nt2.38□□□□□ -2.03
VFA1P40080 HCH1YNL281W 462 nt2.38□□□□□ -2.03
VFA1P40080 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.38□□□□□ -2.03
VFA1P40080 ISW1YBR245C 3390 nt2.38□□□□□ -2.03
VFA1P40080 CRM1YGR218W 3255 nt2.38□□□□□ -2.03
VFA1P40080 SMY2YBR172C 2223 nt2.38□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YDR413CYDR413C 576 nt2.37□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YER097WYER097W 330 nt2.37□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YGL069CYGL069C 465 nt2.37□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YPL229WYPL229W 621 nt2.37□□□□□ -2.03
VFA1P40080 CDC27YBL084C 2277 nt2.37□□□□□ -2.03
VFA1P40080 TRA1YHR099W 11235 nt2.36□□□□□ -2.03
VFA1P40080 PAN3YKL025C 2040 nt2.36□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YBP1YBR216C 2025 nt2.36□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.36□□□□□ -2.03
VFA1P40080 HSK3YKL138C-A 210 nt2.36□□□□□ -2.03
VFA1P40080 DGR1YNL130C-A 147 nt2.36□□□□□ -2.03
VFA1P40080 LYS9YNR050C 1341 nt2.36□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YLR149CYLR149C 2193 nt2.36□□□□□ -2.03
VFA1P40080 NOT5YPR072W 1683 nt2.35□□□□□ -2.03
VFA1P40080 STB4YMR019W 2850 nt2.35□□□□□ -2.03
VFA1P40080 RPL32YBL092W 393 nt2.35□□□□□ -2.03
VFA1P40080 UTP22YGR090W 3714 nt2.35□□□□□ -2.03
VFA1P40080 NUP100YKL068W 2880 nt2.35□□□□□ -2.03
VFA1P40080 TOR1YJR066W 7413 nt2.34□□□□□ -2.03
VFA1P40080 UBP15YMR304W 3693 nt2.34□□□□□ -2.03
VFA1P40080 TOF2YKR010C 2316 nt2.34□□□□□ -2.03
VFA1P40080 SWR1YDR334W 4545 nt2.34□□□□□ -2.03
VFA1P40080 GCN4YEL009C 846 nt2.34□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YER181CYER181C 324 nt2.34□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.34□□□□□ -2.03
VFA1P40080 YBR224WYBR224W 516 nt2.34□□□□□ -2.03
VFA1P40080 PHS1YJL097W 654 nt2.33□□□□□ -2.04
VFA1P40080 PAU8YAL068C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
VFA1P40080 TMA10YLR327C 261 nt2.33□□□□□ -2.04
VFA1P40080 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.33□□□□□ -2.04
VFA1P40080 PAU20YOL161C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
VFA1P40080 VMA9YCL005W-A 222 nt2.33□□□□□ -2.04
VFA1P40080 ALK2YBL009W 2031 nt2.33□□□□□ -2.04
VFA1P40080 RKM1YPL208W 1752 nt2.33□□□□□ -2.04
VFA1P40080 KRE33YNL132W 3171 nt2.33□□□□□ -2.04
VFA1P40080 YDR286CYDR286C 345 nt2.32□□□□□ -2.04
VFA1P40080 HYP2YEL034W 474 nt2.32□□□□□ -2.04
VFA1P40080 RPS27AYKL156W 249 nt2.32□□□□□ -2.04
VFA1P40080 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.32□□□□□ -2.04
VFA1P40080 DAD3YBR233W-A 285 nt2.32□□□□□ -2.04
VFA1P40080 YKU80YMR106C 1890 nt2.32□□□□□ -2.04
VFA1P40080 SMY1YKL079W 1971 nt2.32□□□□□ -2.04
VFA1P40080 MGM1YOR211C 2646 nt2.32□□□□□ -2.04
VFA1P40080 PEP3YLR148W 2757 nt2.32□□□□□ -2.04
VFA1P40080 MET18YIL128W 3099 nt2.31□□□□□ -2.04
VFA1P40080 SEF1YBL066C 3447 nt2.31□□□□□ -2.04
VFA1P40080 RBK1YCR036W 1002 nt2.31□□□□□ -2.04
VFA1P40080 YFL032WYFL032W 321 nt2.31□□□□□ -2.04
VFA1P40080 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.31□□□□□ -2.04
VFA1P40080 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.31□□□□□ -2.04
VFA1P40080 SCH9YHR205W 2475 nt2.31□□□□□ -2.04
VFA1P40080 SGO1YOR073W 1773 nt2.31□□□□□ -2.04
VFA1P40080 TUS1YLR425W 3924 nt2.3□□□□□ -2.04
VFA1P40080 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.3□□□□□ -2.04
VFA1P40080 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.3□□□□□ -2.04
VFA1P40080 RPA34YJL148W 702 nt2.3□□□□□ -2.04
VFA1P40080 snR36snR36 182 nt2.3□□□□□ -2.04
VFA1P40080 YBR184WYBR184W 1572 nt2.3□□□□□ -2.04
VFA1P40080 SEC16YPL085W 6588 nt2.3□□□□□ -2.04
VFA1P40080 UBR1YGR184C 5853 nt2.29□□□□□ -2.04
VFA1P40080 BRE1YDL074C 2103 nt2.29□□□□□ -2.04
VFA1P40080 DFG16YOR030W 1860 nt2.29□□□□□ -2.04
VFA1P40080 ORC2YBR060C 1863 nt2.29□□□□□ -2.04
VFA1P40080 PAC1YOR269W 1485 nt2.29□□□□□ -2.04
VFA1P40080 VTC1YER072W 390 nt2.29□□□□□ -2.04
VFA1P40080 FMP23YBR047W 528 nt2.29□□□□□ -2.04
VFA1P40080 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.29□□□□□ -2.04
VFA1P40080 REV3YPL167C 4515 nt2.29□□□□□ -2.04
VFA1P40080 GUP1YGL084C 1683 nt2.28□□□□□ -2.04
VFA1P40080 SEC31YDL195W 3822 nt2.28□□□□□ -2.04
VFA1P40080 RPL39YJL189W 156 nt2.28□□□□□ -2.04
VFA1P40080 YOR333CYOR333C 417 nt2.28□□□□□ -2.04
VFA1P40080 MNL2YLR057W 2550 nt2.28□□□□□ -2.04
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