Protein–RNA interactions for Protein: P38729

YHL042W, Putative uncharacterized protein YHL042W, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL042WP38729 RPC10YHR143W-A 213 nt0.86□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 LCL2YLR104W 396 nt0.86□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 SWS2YNL081C 432 nt0.86□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 RPL33BYOR234C 324 nt0.86□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.86□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.86□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.86□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 YCL020WYCL020W 1317 nt0.86□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 MVP1YMR004W 1536 nt0.85□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 Q0255Q0255 1419 nt0.85□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 PFD1YJL179W 330 nt0.85□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 UTP13YLR222C 2454 nt0.85□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.85□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 NUP188YML103C 4968 nt0.85□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 MSN5YDR335W 3675 nt0.85□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 SMY1YKL079W 1971 nt0.85□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 DOT6YER088C 2013 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 YBR184WYBR184W 1572 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 GPM2YDL021W 936 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 snR78snR78 87 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 SLX9YGR081C 633 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 DDR48YMR173W 1293 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 CDC31YOR257W 486 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 YPR177CYPR177C 372 nt0.84□□□□□ -2.27
YHL042WP38729 SEC5YDR166C 2916 nt0.84□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 DGR2YKL121W 2559 nt0.84□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 TRM732YMR259C 4263 nt0.83□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 RAD50YNL250W 3939 nt0.83□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 SRP14YDL092W 441 nt0.83□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YDL187CYDL187C 330 nt0.83□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 PRP21YJL203W 843 nt0.83□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YJR079WYJR079W 330 nt0.83□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 RCN1YKL159C 636 nt0.83□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YOR376WYOR376W 369 nt0.83□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YPR063CYPR063C 423 nt0.83□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt0.82□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt0.82□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt0.82□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt0.82□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YGL024WYGL024W 336 nt0.82□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 PRM8YGL053W 714 nt0.82□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 PAU18YLL064C 363 nt0.82□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 PAU6YNR076W 363 nt0.82□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YJR098CYJR098C 1971 nt0.82□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 PEX8YGR077C 1770 nt0.82□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 KAP122YGL016W 3246 nt0.81□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 CHZ1YER030W 462 nt0.81□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YGL217CYGL217C 342 nt0.81□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 SPO13YHR014W 876 nt0.81□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 VPS55YJR044C 423 nt0.81□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YLR252WYLR252W 306 nt0.81□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YPR147CYPR147C 915 nt0.81□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 BUD3YCL014W 4911 nt0.81□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 SFB2YNL049C 2631 nt0.81□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 NST1YNL091W 3723 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 SEF1YBL066C 3447 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 UFD2YDL190C 2886 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 MSS11YMR164C 2277 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 QCR7YDR529C 384 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 IES5YER092W 378 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YOL029CYOL029C 606 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 HHT1YBR010W 411 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 snR14snR14 160 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YCL007CYCL007C 393 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 SPT7YBR081C 3999 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 MUK1YPL070W 1839 nt0.8□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 REV3YPL167C 4515 nt0.79□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 CAT8YMR280C 4302 nt0.79□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 HNT1YDL125C 477 nt0.79□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 ABM1YJR108W 372 nt0.79□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 AFB1YLR040C 675 nt0.79□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 NBP1YLR457C 960 nt0.79□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YNL114CYNL114C 372 nt0.79□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 FMP23YBR047W 528 nt0.79□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 SMC1YFL008W 3678 nt0.78□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 PAU2YEL049W 363 nt0.78□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 YFL012WYFL012W 447 nt0.78□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 TIM18YOR297C 579 nt0.78□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 IRC16YPR038W 360 nt0.78□□□□□ -2.28
YHL042WP38729 SLX4YLR135W 2247 nt0.77□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YDL211CYDL211C 1119 nt0.77□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 SMB1YER029C 591 nt0.77□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YER121WYER121W 345 nt0.77□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 VMA21YGR105W 234 nt0.77□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.77□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YLL020CYLL020C 306 nt0.77□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 GMC2YLR445W 567 nt0.77□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 BEM2YER155C 6504 nt0.77□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 SAC3YDR159W 3906 nt0.77□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 PPN1YDR452W 2025 nt0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.1 ms