Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	GDS1	YOR355W	1569 nt		1.54	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YBP1	YBR216C	2025 nt		1.54	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	MNL2	YLR057W	2550 nt		1.53	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YOR343W-B	YOR343W-B	5313 nt		1.53	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	BTT1	YDR252W	450 nt		1.53	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YGR042W	YGR042W	816 nt		1.53	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	tT(UGU)H	tT(UGU)H	72 nt		1.53	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YHR214C-C	YHR214C-C	1437 nt		1.53	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	YMR052C-A	YMR052C-A	366 nt		1.53	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	CMC2	YBL059C-A	330 nt		1.53	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	NOP15	YNL110C	663 nt		1.53	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	EGD1	YPL037C	474 nt		1.53	□□□□□ -2.16
ATG12	P38316	SMB1	YER029C	591 nt		1.52	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	HUR1	YGL168W	333 nt		1.52	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	RPC10	YHR143W-A	213 nt		1.52	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YLR171W	YLR171W	390 nt		1.52	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YOR192C-C	YOR192C-C	237 nt		1.52	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	PRM3	YPL192C	402 nt		1.52	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	GPX2	YBR244W	489 nt		1.52	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	NUP82	YJL061W	2142 nt		1.52	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	VMR1	YHL035C	4779 nt		1.52	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	VPS35	YJL154C	2835 nt		1.52	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	TFC8	YPL007C	1767 nt		1.52	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	UTP13	YLR222C	2454 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YNL144C	YNL144C	2223 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	GNT1	YOR320C	1476 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YLR419W	YLR419W	4308 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YJR039W	YJR039W	3366 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	RTR2	YDR066C	591 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YFL019C	YFL019C	354 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YGL069C	YGL069C	465 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YJR140W-A	YJR140W-A	150 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YML108W	YML108W	318 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YPL197C	YPL197C	414 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	LHS1	YKL073W	2646 nt		1.51	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	IRA1	YBR140C	9279 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YBR012W-A	YBR012W-A	1323 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YOR142W-A	YOR142W-A	1323 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YPR158W-A	YPR158W-A	1323 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YEL018C-A	YEL018C-A	534 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YJL007C	YJL007C	315 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	SPC1	YJR010C-A	285 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YKL202W	YKL202W	582 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	IRC19	YLL033W	693 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	COX7	YMR256C	183 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	ZRG8	YER033C	3231 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	SSK2	YNR031C	4740 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	SNF5	YBR289W	2718 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YLR035C-A	YLR035C-A	3468 nt		1.5	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	SLM1	YIL105C	2061 nt		1.49	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	PKH3	YDR466W	2697 nt		1.49	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	IES5	YER092W	378 nt		1.49	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YHR130C	YHR130C	336 nt		1.49	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	NCE101	YJL205C	162 nt		1.49	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	HSK3	YKL138C-A	210 nt		1.49	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YMR153C-A	YMR153C-A	336 nt		1.49	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	PGA1	YNL158W	597 nt		1.49	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	RTC6	YPL183W-A	282 nt		1.49	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	VPS15	YBR097W	4365 nt		1.49	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	SGD1	YLR336C	2700 nt		1.49	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	IRE1	YHR079C	3348 nt		1.48	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YGR130C	YGR130C	2451 nt		1.48	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	PLC1	YPL268W	2610 nt		1.48	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	LAA1	YJL207C	6045 nt		1.48	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YLR101C	YLR101C	396 nt		1.48	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		1.48	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	SMY1	YKL079W	1971 nt		1.48	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YDR114C	YDR114C	303 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YER135C	YER135C	393 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	tQ(UUG)E2	tQ(UUG)E2	72 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	BIG1	YHR101C	1008 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YKL111C	YKL111C	336 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	SEC22	YLR268W	645 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	SEN15	YMR059W	387 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YMR324C	YMR324C	243 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YOR248W	YOR248W	303 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	YOR394C-A	YOR394C-A	168 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	LEE1	YPL054W	906 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	TDA9	YML081W	3756 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	NOP53	YPL146C	1368 nt		1.47	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	MSH6	YDR097C	3729 nt		1.46	□□□□□ -2.17
ATG12	P38316	NOT5	YPR072W	1683 nt		1.46	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	HMRA1	YCR097W	381 nt		1.46	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	ATP6	Q0085	780 nt		1.46	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	YLR406C-A	YLR406C-A	150 nt		1.46	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	YMR247W-A	YMR247W-A	144 nt		1.46	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	SAR1	YPL218W	573 nt		1.46	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	RKM1	YPL208W	1752 nt		1.46	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	YLR149C	YLR149C	2193 nt		1.45	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	KAR3	YPR141C	2190 nt		1.45	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	DAS1	YJL149W	1992 nt		1.45	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		1.45	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	YER079W	YER079W	633 nt		1.45	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	YER188C-A	YER188C-A	300 nt		1.45	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	YGR025W	YGR025W	303 nt		1.45	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	ECL1	YGR146C	636 nt		1.45	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	YBR174C	YBR174C	315 nt		1.45	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	YDL041W	YDL041W	354 nt		1.44	□□□□□ -2.18
ATG12	P38316	NBL1	YHR199C-A	222 nt		1.44	□□□□□ -2.18

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.4 ms