Protein–RNA interactions for Protein: P36075

CUE2, Ubiquitin-binding protein CUE2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE2P36075 YGR250CYGR250C 2346 nt2.66□□□□□ -1.98
CUE2P36075 SGM1YJR134C 2124 nt2.66□□□□□ -1.98
CUE2P36075 NAB3YPL190C 2409 nt2.66□□□□□ -1.98
CUE2P36075 YJL181WYJL181W 1836 nt2.65□□□□□ -1.98
CUE2P36075 YNL034WYNL034W 1839 nt2.65□□□□□ -1.98
CUE2P36075 YIL166CYIL166C 1629 nt2.65□□□□□ -1.98
CUE2P36075 YDR426CYDR426C 378 nt2.65□□□□□ -1.99
CUE2P36075 HYP2YEL034W 474 nt2.65□□□□□ -1.99
CUE2P36075 LCL1YPL056C 306 nt2.65□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.65□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.65□□□□□ -1.99
CUE2P36075 snR46snR46 197 nt2.65□□□□□ -1.99
CUE2P36075 PDS5YMR076C 3834 nt2.65□□□□□ -1.99
CUE2P36075 TRS130YMR218C 3309 nt2.64□□□□□ -1.99
CUE2P36075 SMY2YBR172C 2223 nt2.64□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YGL239CYGL239C 315 nt2.64□□□□□ -1.99
CUE2P36075 RPS27BYHR021C 249 nt2.64□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt2.64□□□□□ -1.99
CUE2P36075 RRT15YLR162W-A 189 nt2.64□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YML037CYML037C 1023 nt2.64□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.64□□□□□ -1.99
CUE2P36075 AI2Q0055 2565 nt2.64□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YKU80YMR106C 1890 nt2.64□□□□□ -1.99
CUE2P36075 NPC2YDL046W 522 nt2.63□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YIL058WYIL058W 285 nt2.63□□□□□ -1.99
CUE2P36075 UBP15YMR304W 3693 nt2.63□□□□□ -1.99
CUE2P36075 APC2YLR127C 2562 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 SEC26YDR238C 2922 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YCL019WYCL019W 5313 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 TOF2YKR010C 2316 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YLL007CYLL007C 1998 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YER121WYER121W 345 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 MRD1YPR112C 2664 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 SIR3YLR442C 2937 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YER138CYER138C 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YER160CYER160C 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YJR027WYJR027W 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YML039WYML039W 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YML045WYML045W 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YMR050CYMR050C 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.62□□□□□ -1.99
CUE2P36075 SUL1YBR294W 2580 nt2.61□□□□□ -1.99
CUE2P36075 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.61□□□□□ -1.99
CUE2P36075 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.61□□□□□ -1.99
CUE2P36075 INA22YIR024C 651 nt2.61□□□□□ -1.99
CUE2P36075 RPS27AYKL156W 249 nt2.61□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YOR376WYOR376W 369 nt2.61□□□□□ -1.99
CUE2P36075 TRM7YBR061C 933 nt2.61□□□□□ -1.99
CUE2P36075 GIN4YDR507C 3429 nt2.61□□□□□ -1.99
CUE2P36075 TCB2YNL087W 3537 nt2.61□□□□□ -1.99
CUE2P36075 SWA2YDR320C 2007 nt2.61□□□□□ -1.99
CUE2P36075 TFB1YDR311W 1929 nt2.6□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YPL150WYPL150W 2706 nt2.6□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YDR544CYDR544C 429 nt2.6□□□□□ -1.99
CUE2P36075 APC9YLR102C 798 nt2.6□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YMR324CYMR324C 243 nt2.6□□□□□ -1.99
CUE2P36075 RLI1YDR091C 1827 nt2.6□□□□□ -1.99
CUE2P36075 RPO41YFL036W 4056 nt2.6□□□□□ -1.99
CUE2P36075 SAK1YER129W 3429 nt2.59□□□□□ -1.99
CUE2P36075 PDE2YOR360C 1581 nt2.59□□□□□ -1.99
CUE2P36075 RBK1YCR036W 1002 nt2.59□□□□□ -1.99
CUE2P36075 snR74snR74 88 nt2.59□□□□□ -1.99
CUE2P36075 SSS1YDR086C 243 nt2.59□□□□□ -1.99
CUE2P36075 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.59□□□□□ -1.99
CUE2P36075 ECM5YMR176W 4236 nt2.59□□□□□ -1.99
CUE2P36075 KRE33YNL132W 3171 nt2.59□□□□□ -2
CUE2P36075 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.58□□□□□ -2
CUE2P36075 PRP42YDR235W 1635 nt2.58□□□□□ -2
CUE2P36075 FAR11YNL127W 2862 nt2.58□□□□□ -2
CUE2P36075 NCL1YBL024W 2055 nt2.58□□□□□ -2
CUE2P36075 BRO1YPL084W 2535 nt2.58□□□□□ -2
CUE2P36075 TFB5YDR079C-A 219 nt2.58□□□□□ -2
CUE2P36075 YIL059CYIL059C 366 nt2.58□□□□□ -2
CUE2P36075 RPS29AYLR388W 171 nt2.58□□□□□ -2
CUE2P36075 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.58□□□□□ -2
CUE2P36075 KHA1YJL094C 2622 nt2.58□□□□□ -2
CUE2P36075 DUG2YBR281C 2637 nt2.58□□□□□ -2
CUE2P36075 IPT1YDR072C 1584 nt2.57□□□□□ -2
CUE2P36075 ARP8YOR141C 2646 nt2.57□□□□□ -2
CUE2P36075 QCR7YDR529C 384 nt2.57□□□□□ -2
CUE2P36075 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.57□□□□□ -2
CUE2P36075 YPR092WYPR092W 306 nt2.57□□□□□ -2
CUE2P36075 SEC5YDR166C 2916 nt2.57□□□□□ -2
CUE2P36075 DIS3YOL021C 3006 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.3 ms