Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2E1P29083 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms