Protein–RNA interactions for Protein: P0C0T4

RPS25B, 40S ribosomal protein S25-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS25BP0C0T4 RCN1YKL159C 636 nt0.72□□□□□ -2.29
RPS25BP0C0T4 HYM1YKL189W 1200 nt0.72□□□□□ -2.29
RPS25BP0C0T4 ARV1YLR242C 966 nt0.72□□□□□ -2.29
RPS25BP0C0T4 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.72□□□□□ -2.29
RPS25BP0C0T4 YPR172WYPR172W 603 nt0.72□□□□□ -2.29
RPS25BP0C0T4 YCL046WYCL046W 324 nt0.72□□□□□ -2.29
RPS25BP0C0T4 VPS54YDR027C 2670 nt0.72□□□□□ -2.29
RPS25BP0C0T4 NUP120YKL057C 3114 nt0.72□□□□□ -2.29
RPS25BP0C0T4 KAR3YPR141C 2190 nt0.72□□□□□ -2.29
RPS25BP0C0T4 snR83snR83 306 nt0.71□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.71□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 RNR4YGR180C 1038 nt0.71□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 CRG1YHR209W 876 nt0.71□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 DDR48YMR173W 1293 nt0.71□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.71□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YNL235CYNL235C 432 nt0.71□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 SLS1YLR139C 1932 nt0.7□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 STB6YKL072W 2301 nt0.7□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 GUP1YGL084C 1683 nt0.7□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 TDA2YER071C 381 nt0.7□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 ACF4YJR083C 930 nt0.7□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 FMP23YBR047W 528 nt0.7□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.69□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.69□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 ZRG17YNR039C 1818 nt0.69□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 REF2YDR195W 1602 nt0.69□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 RTR1YER139C 681 nt0.69□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YPL080CYPL080C 327 nt0.69□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 MAK10YEL053C 2202 nt0.69□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YGR265WYGR265W 411 nt0.68□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 ANS1YHR126C 480 nt0.68□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 RPL42BYHR141C 321 nt0.68□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 RPL42AYNL162W 321 nt0.68□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YPR117WYPR117W 7470 nt0.67□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.67□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 CHZ1YER030W 462 nt0.67□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YIR020CYIR020C 303 nt0.67□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 PAU18YLL064C 363 nt0.67□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 CMS1YLR003C 876 nt0.67□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 PAU6YNR076W 363 nt0.67□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 IRC23YOR044W 474 nt0.67□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 ATP20YPR020W 348 nt0.67□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 SWI4YER111C 3282 nt0.67□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YBR184WYBR184W 1572 nt0.66□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 SGO1YOR073W 1773 nt0.66□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 PAU2YEL049W 363 nt0.66□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 IES5YER092W 378 nt0.66□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 CWC23YGL128C 852 nt0.66□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.66□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.66□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 YOR364WYOR364W 369 nt0.66□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 MDM32YOR147W 1869 nt0.66□□□□□ -2.3
RPS25BP0C0T4 APL3YBL037W 3078 nt0.65□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 KAP120YPL125W 3099 nt0.65□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 SEC1YDR164C 2175 nt0.65□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 VMA7YGR020C 357 nt0.65□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 LIN1YHR156C 1023 nt0.65□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 RPL9BYNL067W 576 nt0.65□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 GDS1YOR355W 1569 nt0.65□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 SAS3YBL052C 2496 nt0.64□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 RTT102YGR275W 474 nt0.64□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 RPL37AYLR185W 267 nt0.64□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YLR217WYLR217W 324 nt0.64□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YBL073WYBL073W 312 nt0.64□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 SPT21YMR179W 2277 nt0.64□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YCL020WYCL020W 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YLL054CYLL054C 2532 nt0.63□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 SEC3YER008C 4011 nt0.63□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YOL106WYOL106W 354 nt0.63□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 VPS52YDR484W 1926 nt0.63□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 RRI2YOL117W 1938 nt0.63□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 SAG1YJR004C 1953 nt0.63□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 PIP2YOR363C 2991 nt0.62□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 BUD3YCL014W 4911 nt0.62□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 SRP14YDL092W 441 nt0.62□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 COX7YMR256C 183 nt0.62□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YNL150WYNL150W 408 nt0.62□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 DCP2YNL118C 2913 nt0.61□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.61□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 SWS2YNL081C 432 nt0.61□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 UBS1YBR165W 834 nt0.61□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 AIM9YER080W 1884 nt0.61□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 HDA3YPR179C 1968 nt0.6□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.6□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YHR054CYHR054C 1065 nt0.6□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 SMD3YLR147C 306 nt0.6□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YLR366WYLR366W 306 nt0.6□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.6□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.6□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YPR170CYPR170C 336 nt0.6□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 SHE9YDR393W 1371 nt0.59□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 snR79snR79 84 nt0.59□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 NHP2YDL208W 471 nt0.59□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YFR057WYFR057W 456 nt0.59□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.59□□□□□ -2.31
RPS25BP0C0T4 YCS4YLR272C 3531 nt0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.6 ms