Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms