Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SMAD1Q15797 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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SMAD1Q15797 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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SMAD1Q15797 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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SMAD1Q15797 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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