Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 FLO11YIR019C 4104 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 REV1YOR346W 2958 nt2.73□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 SRO77YBL106C 3033 nt2.72□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YPR089WYPR089W 2667 nt2.72□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 AIM9YER080W 1884 nt2.72□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.72□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 LCL1YPL056C 306 nt2.72□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 KAR3YPR141C 2190 nt2.72□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 RKM1YPL208W 1752 nt2.72□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 RGA2YDR379W 3030 nt2.71□□□□□ -1.97
VHS3Q08438 AMS1YGL156W 3252 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 TCB2YNL087W 3537 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 KSP1YHR082C 3090 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 SEC26YDR238C 2922 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YLR012CYLR012C 300 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 PRP6YBR055C 2700 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 ESL2YKR096W 3588 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 PTC5YOR090C 1719 nt2.71□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 DBP10YDL031W 2988 nt2.7□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 NCL1YBL024W 2055 nt2.7□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 PSD2YGR170W 3417 nt2.7□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 QCR7YDR529C 384 nt2.7□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YGL024WYGL024W 336 nt2.7□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 GRX8YLR364W 330 nt2.7□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 RTC6YPL183W-A 282 nt2.7□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 PRK1YIL095W 2433 nt2.7□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 HOS4YIL112W 3252 nt2.69□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 SUL1YBR294W 2580 nt2.69□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 HRD3YLR207W 2502 nt2.69□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 UBP11YKR098C 2154 nt2.69□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YFL063WYFL063W 456 nt2.69□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YGR050CYGR050C 357 nt2.69□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 TIM13YGR181W 318 nt2.69□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.69□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 SDC25YLL016W 3147 nt2.69□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 IRA2YOL081W 9240 nt2.69□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YPL150WYPL150W 2706 nt2.69□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 DIS3YOL021C 3006 nt2.68□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 MRD1YPR112C 2664 nt2.68□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 HMRA2YCR096C 360 nt2.68□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 snR8snR8 190 nt2.68□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 HSK3YKL138C-A 210 nt2.68□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 HCH1YNL281W 462 nt2.68□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 CRS5YOR031W 210 nt2.68□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.68□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 NOT5YPR072W 1683 nt2.68□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 BNR1YIL159W 4128 nt2.67□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 RPL32YBL092W 393 nt2.66□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YIL080WYIL080W 4722 nt2.66□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 SGO1YOR073W 1773 nt2.66□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 NFT1YKR103W 3657 nt2.65□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YDR239CYDR239C 2364 nt2.65□□□□□ -1.98
VHS3Q08438 YMR320WYMR320W 306 nt2.65□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 VPS35YJL154C 2835 nt2.65□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 OST1YJL002C 1431 nt2.65□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 SGD1YLR336C 2700 nt2.65□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 SWA2YDR320C 2007 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 OSW7YFR039C 1533 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 SMY2YBR172C 2223 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 FMP16YDR070C 282 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 HYP2YEL034W 474 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 YEL057CYEL057C 702 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 TAR1YLR154W-C 375 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 TMA10YLR327C 261 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 YNL018CYNL018C 1839 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 SNU114YKL173W 3027 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 RPL35AYDL191W 363 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 GCN4YEL009C 846 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 SMD1YGR074W 441 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 YPR099CYPR099C 357 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 ARP8YOR141C 2646 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 ACB1YGR037C 264 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 TOP2YNL088W 4287 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 PAC1YOR269W 1485 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 CSN9YDR179C 489 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 COX14YML129C 213 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 SNC2YOR327C 348 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 BFA1YJR053W 1725 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 KEL2YGR238C 2649 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 DOT6YER088C 2013 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 YKU80YMR106C 1890 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 INP51YIL002C 2841 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 VPS16YPL045W 2397 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 NOP10YHR072W-A 177 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 RPS27AYKL156W 249 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 SGM1YJR134C 2124 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 FKS3YMR306W 5358 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 HSC82YMR186W 2118 nt2.59□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 EDS1YBR033W 2760 nt2.59□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 MCM22YJR135C 720 nt2.59□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 ACM1YPL267W 630 nt2.59□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 YBR277CYBR277C 402 nt2.59□□□□□ -1.99
VHS3Q08438 FAR11YNL127W 2862 nt2.58□□□□□ -2
VHS3Q08438 PHS1YJL097W 654 nt2.58□□□□□ -2
VHS3Q08438 RPS29AYLR388W 171 nt2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 101.6 ms