Protein–RNA interactions for Protein: Q03330

GCN5, Histone acetyltransferase GCN5, yeastyeast

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN5Q03330 MRPL33YMR286W 261 nt3.05□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 YNL028WYNL028W 318 nt3.05□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 POL2YNL262W 6669 nt3.05□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 HFM1YGL251C 3564 nt3.05□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 BCH1YMR237W 2175 nt3.04□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 KAP104YBR017C 2757 nt3.04□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 HEH2YDR458C 1992 nt3.04□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 SNQ2YDR011W 4506 nt3.04□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 TFB1YDR311W 1929 nt3.04□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 PCC1YKR095W-A 267 nt3.04□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 YMR324CYMR324C 243 nt3.04□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt3.04□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 TFC1YBR123C 1950 nt3.03□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 RBK1YCR036W 1002 nt3.03□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt3.03□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 YOR015WYOR015W 360 nt3.03□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 PHO2YDL106C 1680 nt3.03□□□□□ -1.92
GCN5Q03330 APC2YLR127C 2562 nt3.03□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 HDA3YPR179C 1968 nt3.02□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 RPS27AYKL156W 249 nt3.02□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 CSE2YNR010W 450 nt3.02□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 SEC15YGL233W 2733 nt3.02□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 DIS3YOL021C 3006 nt3.02□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 DRS2YAL026C 4068 nt3.01□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 GCD6YDR211W 2139 nt3.01□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 KEL2YGR238C 2649 nt3.01□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 SSE1YPL106C 2082 nt3.01□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 YOR296WYOR296W 3870 nt3.01□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 FLO1YAR050W 4614 nt3.01□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 COG3YER157W 2406 nt3□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 MDM20YOL076W 2391 nt3□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 APC11YDL008W 498 nt3□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 QCR7YDR529C 384 nt3□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 VTC1YER072W 390 nt3□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 UPS1YLR193C 528 nt3□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 RPL20BYOR312C 519 nt3□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 YBR224WYBR224W 516 nt3□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 FUN30YAL019W 3396 nt3□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 DBP10YDL031W 2988 nt2.99□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 YIL059CYIL059C 366 nt2.99□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 RRT15YLR162W-A 189 nt2.99□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 NMD2YHR077C 3270 nt2.99□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 TSC11YER093C 4293 nt2.99□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 YAT2YER024W 2772 nt2.98□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 LRE1YCL051W 1752 nt2.98□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 NCL1YBL024W 2055 nt2.98□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 YGL217CYGL217C 342 nt2.98□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 LSO2YGR169C-A 279 nt2.98□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.98□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 RPL6AYML073C 531 nt2.98□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 VBA4YDR119W 2307 nt2.98□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 BUD4YJR092W 4344 nt2.97□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 YHL005CYHL005C 393 nt2.97□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 RPL38YLR325C 237 nt2.97□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 RLF2YPR018W 1821 nt2.97□□□□□ -1.93
GCN5Q03330 ILS1YBL076C 3219 nt2.96□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 ORC1YML065W 2745 nt2.96□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 RSE1YML049C 4086 nt2.96□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 SMD1YGR074W 441 nt2.95□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 CHS2YBR038W 2892 nt2.95□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 KAR3YPR141C 2190 nt2.95□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 PHO81YGR233C 3537 nt2.95□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 ECM21YBL101C 3354 nt2.95□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 LCD1YDR499W 2244 nt2.95□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YPP1YGR198W 2454 nt2.94□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YDR426CYDR426C 378 nt2.94□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YMR31YFR049W 372 nt2.94□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.94□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.94□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 snR52snR52 92 nt2.94□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 MDM1YML104C 3384 nt2.94□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 PDE2YOR360C 1581 nt2.94□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.94□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 CDC20YGL116W 1833 nt2.93□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 SNU114YKL173W 3027 nt2.93□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YLR278CYLR278C 4026 nt2.93□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 CHS3YBR023C 3498 nt2.93□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YGL024WYGL024W 336 nt2.93□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YGL069CYGL069C 465 nt2.93□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 RAM2YKL019W 951 nt2.93□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YOR376WYOR376W 369 nt2.93□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 CUL3YGR003W 2235 nt2.93□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 SIN3YOL004W 4611 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 MSH2YOL090W 2895 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 DBP7YKR024C 2229 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 MDV1YJL112W 2145 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 DYN1YKR054C 12279 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 REG1YDR028C 3045 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 RIF1YBR275C 5751 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 SSS1YDR086C 243 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 ERP6YGL002W 651 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 RPL25YOL127W 429 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YBL109WYBL109W 336 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 snR46snR46 197 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 VAS1YGR094W 3315 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 PMR1YGL167C 2853 nt2.92□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 CDC27YBL084C 2277 nt2.91□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 TOF2YKR010C 2316 nt2.91□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 DFG16YOR030W 1860 nt2.91□□□□□ -1.94
GCN5Q03330 YIL169CYIL169C 2988 nt2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.6 ms