Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 YDR341CYDR341C 1824 nt1.98□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 ATP17YDR377W 306 nt1.98□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 RPS22BYLR367W 393 nt1.98□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt1.98□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 snR41snR41 95 nt1.98□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 GPX2YBR244W 489 nt1.98□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 SEC16YPL085W 6588 nt1.98□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 SAP185YJL098W 3177 nt1.98□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 IRC20YLR247C 4671 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 NOT5YPR072W 1683 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 RVS161YCR009C 798 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YDL062WYDL062W 426 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 RPL37BYDR500C 267 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 VTC1YER072W 390 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YER121WYER121W 345 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 HUR1YGL168W 333 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 NBL1YHR199C-A 222 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 EGD1YPL037C 474 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 snR54snR54 86 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 IRC8YJL051W 2469 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 SMC6YLR383W 3345 nt1.97□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 COX1Q0045 1605 nt1.96□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 SYH1YPL105C 2550 nt1.96□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 IES5YER092W 378 nt1.96□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.96□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YJL007CYJL007C 315 nt1.96□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 VMA9YCL005W-A 222 nt1.96□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 SET2YJL168C 2202 nt1.96□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 SCD5YOR329C 2619 nt1.96□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 MSS11YMR164C 2277 nt1.96□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 KOG1YHR186C 4674 nt1.96□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 LYS9YNR050C 1341 nt1.95□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 RPS18BYML026C 441 nt1.95□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 SPP41YDR464W 4308 nt1.95□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.95□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YLR149CYLR149C 2193 nt1.95□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 SIR4YDR227W 4077 nt1.95□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 TFC3YAL001C 3483 nt1.94□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 UBP1YDL122W 2430 nt1.94□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YGL024WYGL024W 336 nt1.94□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YML084WYML084W 309 nt1.94□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YPR146CYPR146C 330 nt1.94□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YBR224WYBR224W 516 nt1.94□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 BUD2YKL092C 3315 nt1.93□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 FCF2YLR051C 654 nt1.93□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 CDC33YOL139C 642 nt1.93□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 SCH9YHR205W 2475 nt1.93□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 CAT2YML042W 2013 nt1.93□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 NAM7YMR080C 2916 nt1.92□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YSW1YBR148W 1830 nt1.92□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 ATP7YKL016C 525 nt1.92□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YLR101CYLR101C 396 nt1.92□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YPL205CYPL205C 345 nt1.92□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 MNL2YLR057W 2550 nt1.92□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 GRR1YJR090C 3456 nt1.92□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 MCD1YDL003W 1701 nt1.91□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 RBK1YCR036W 1002 nt1.91□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.91□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 RPS24AYER074W 408 nt1.91□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YER135CYER135C 393 nt1.91□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 RRF1YHR038W 693 nt1.91□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YBL083CYBL083C 426 nt1.91□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 PLC1YPL268W 2610 nt1.91□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 PDR8YLR266C 2106 nt1.91□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 ELG1YOR144C 2376 nt1.91□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 ATG9YDL149W 2994 nt1.9□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 PEP3YLR148W 2757 nt1.9□□□□□ -2.1
SKO1Q02100 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.9□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 TMA22YJR014W 597 nt1.9□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 CMC2YBL059C-A 330 nt1.9□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 CYB5YNL111C 363 nt1.9□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 PET309YLR067C 2898 nt1.9□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 SAP190YKR028W 3102 nt1.9□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 HER1YOR227W 3741 nt1.9□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 YOL098CYOL098C 3114 nt1.89□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 QCR7YDR529C 384 nt1.89□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.89□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.89□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.89□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 PGA1YNL158W 597 nt1.89□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 YBR032WYBR032W 303 nt1.89□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.89□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 RPH1YER169W 2391 nt1.88□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 MYO4YAL029C 4416 nt1.88□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 SLM1YIL105C 2061 nt1.88□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 RPL27BYDR471W 411 nt1.88□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 BRP1YGL007W 378 nt1.88□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 YJR157WYJR157W 363 nt1.88□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 TIF11YMR260C 462 nt1.88□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 ARP7YPR034W 1434 nt1.88□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 SMY1YKL079W 1971 nt1.88□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 GCN4YEL009C 846 nt1.87□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 NFU1YKL040C 771 nt1.87□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 DGR1YNL130C-A 147 nt1.87□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 YCL023CYCL023C 348 nt1.87□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 MYO2YOR326W 4725 nt1.86□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 YCR043CYCR043C 384 nt1.86□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 BTT1YDR252W 450 nt1.86□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.86□□□□□ -2.11
SKO1Q02100 URM1YIL008W 300 nt1.86□□□□□ -2.11
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