Protein–RNA interactions for Protein: P43124

NSE4, Non-structural maintenance of chromosome element 4, yeastyeast

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4P43124 SLS1YLR139C 1932 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 AZF1YOR113W 2745 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 SHE4YOR035C 2370 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 PEX8YGR077C 1770 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 VPS55YJR044C 423 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 CTK3YML112W 891 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YMR324CYMR324C 243 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 RPS7BYNL096C 573 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE4P43124 SMC1YFL008W 3678 nt0.88□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt0.88□□□□□ -2.27
NSE4P43124 TDA2YER071C 381 nt0.88□□□□□ -2.27
NSE4P43124 SEC22YLR268W 645 nt0.88□□□□□ -2.27
NSE4P43124 SAG1YJR004C 1953 nt0.88□□□□□ -2.27
NSE4P43124 DPB11YJL090C 2295 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE4P43124 PEP3YLR148W 2757 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YDR537CYDR537C 606 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE4P43124 VMA7YGR020C 357 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE4P43124 LSO2YGR169C-A 279 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE4P43124 NUP82YJL061W 2142 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE4P43124 ARV1YLR242C 966 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE4P43124 CGI121YML036W 546 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE4P43124 URA10YMR271C 684 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YPL080CYPL080C 327 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YDL068WYDL068W 330 nt0.86□□□□□ -2.27
NSE4P43124 IRC2YDR112W 309 nt0.86□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.86□□□□□ -2.27
NSE4P43124 LIN1YHR156C 1023 nt0.86□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.86□□□□□ -2.27
NSE4P43124 TIM8YJR135W-A 264 nt0.86□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YOR376WYOR376W 369 nt0.86□□□□□ -2.27
NSE4P43124 SMY1YKL079W 1971 nt0.86□□□□□ -2.27
NSE4P43124 SNF5YBR289W 2718 nt0.86□□□□□ -2.27
NSE4P43124 SFB2YNL049C 2631 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 SGD1YLR336C 2700 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YFR057WYFR057W 456 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 RNR4YGR180C 1038 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YJL119CYJL119C 324 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 SMD3YLR147C 306 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YLR217WYLR217W 324 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 RPB11YOL005C 363 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YOL106WYOL106W 354 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YPR063CYPR063C 423 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YPR146CYPR146C 330 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 OSH6YKR003W 1347 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 NUP188YML103C 4968 nt0.85□□□□□ -2.27
NSE4P43124 CWC23YGL128C 852 nt0.84□□□□□ -2.27
NSE4P43124 ACF4YJR083C 930 nt0.84□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.84□□□□□ -2.27
NSE4P43124 HHT1YBR010W 411 nt0.84□□□□□ -2.27
NSE4P43124 FMP23YBR047W 528 nt0.84□□□□□ -2.27
NSE4P43124 YJR098CYJR098C 1971 nt0.84□□□□□ -2.28
NSE4P43124 SEC5YDR166C 2916 nt0.84□□□□□ -2.28
NSE4P43124 UFD2YDL190C 2886 nt0.83□□□□□ -2.28
NSE4P43124 KAR3YPR141C 2190 nt0.83□□□□□ -2.28
NSE4P43124 YDL211CYDL211C 1119 nt0.83□□□□□ -2.28
NSE4P43124 YHC1YLR298C 696 nt0.83□□□□□ -2.28
NSE4P43124 RPS18BYML026C 441 nt0.83□□□□□ -2.28
NSE4P43124 YPL039WYPL039W 951 nt0.83□□□□□ -2.28
NSE4P43124 YPR172WYPR172W 603 nt0.83□□□□□ -2.28
NSE4P43124 VPS54YDR027C 2670 nt0.82□□□□□ -2.28
NSE4P43124 IFH1YLR223C 3258 nt0.82□□□□□ -2.28
NSE4P43124 CRG1YHR209W 876 nt0.82□□□□□ -2.28
NSE4P43124 EMC5YIL027C 426 nt0.82□□□□□ -2.28
NSE4P43124 RPL37AYLR185W 267 nt0.82□□□□□ -2.28
NSE4P43124 BRX1YOL077C 876 nt0.82□□□□□ -2.28
NSE4P43124 ERP4YOR016C 624 nt0.82□□□□□ -2.28
NSE4P43124 YOR364WYOR364W 369 nt0.82□□□□□ -2.28
NSE4P43124 MEI5YPL121C 669 nt0.82□□□□□ -2.28
NSE4P43124 KAR1YNL188W 1302 nt0.82□□□□□ -2.28
NSE4P43124 SEF1YBL066C 3447 nt0.82□□□□□ -2.28
NSE4P43124 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.81□□□□□ -2.28
NSE4P43124 ABM1YJR108W 372 nt0.81□□□□□ -2.28
NSE4P43124 YNL235CYNL235C 432 nt0.81□□□□□ -2.28
NSE4P43124 YCL023CYCL023C 348 nt0.81□□□□□ -2.28
NSE4P43124 DOP1YDR141C 5097 nt0.81□□□□□ -2.28
NSE4P43124 RRI2YOL117W 1938 nt0.81□□□□□ -2.28
NSE4P43124 RAD50YNL250W 3939 nt0.81□□□□□ -2.28
NSE4P43124 YBR184WYBR184W 1572 nt0.8□□□□□ -2.28
NSE4P43124 REF2YDR195W 1602 nt0.8□□□□□ -2.28
NSE4P43124 IES5YER092W 378 nt0.8□□□□□ -2.28
NSE4P43124 CMS1YLR003C 876 nt0.8□□□□□ -2.28
NSE4P43124 SPC2YML055W 537 nt0.8□□□□□ -2.28
NSE4P43124 YNL150WYNL150W 408 nt0.8□□□□□ -2.28
NSE4P43124 TIM18YOR297C 579 nt0.8□□□□□ -2.28
NSE4P43124 EAF1YDR359C 2949 nt0.8□□□□□ -2.28
NSE4P43124 MUK1YPL070W 1839 nt0.8□□□□□ -2.28
NSE4P43124 MDM32YOR147W 1869 nt0.8□□□□□ -2.28
NSE4P43124 SPO75YLL005C 2607 nt0.79□□□□□ -2.28
NSE4P43124 RSM27YGR215W 333 nt0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.4 ms