Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A1Q9Y2Q0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms