Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VPREB3Q9UKI3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms