Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CGGBP1Q9UFW8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CGGBP1Q9UFW8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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