Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NECAP2Q9NVZ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms