Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 YGL024WYGL024W 336 nt3.3□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 RLI1YDR091C 1827 nt3.3□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 STT4YLR305C 5703 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 USE1YGL098W 738 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 LSM7YNL147W 348 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 RTC6YPL183W-A 282 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 YHR080CYHR080C 4038 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 MPH1YIR002C 2982 nt3.29□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 ORC1YML065W 2745 nt3.28□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.28□□□□□ -1.88
MCD1Q12158 CHO2YGR157W 2610 nt3.27□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 RGR1YLR071C 3249 nt3.27□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 DBP6YNR038W 1890 nt3.27□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.27□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YDL062WYDL062W 426 nt3.27□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 CDC36YDL165W 576 nt3.27□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 STU2YLR045C 2667 nt3.27□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 PSK1YAL017W 4071 nt3.27□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 DNL4YOR005C 2835 nt3.27□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 PKH1YDR490C 2301 nt3.26□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 RCY1YJL204C 2523 nt3.26□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 PAU10YDR542W 363 nt3.26□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 PAU11YGL261C 363 nt3.26□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YIL102CYIL102C 306 nt3.26□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 GRX8YLR364W 330 nt3.26□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 PAU4YLR461W 363 nt3.26□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YSP2YDR326C 4317 nt3.26□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 NAB3YPL190C 2409 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 BUD4YJR092W 4344 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 PHS1YJL097W 654 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 RPS27AYKL156W 249 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 snR49snR49 165 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 GCN1YGL195W 8019 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 ARP7YPR034W 1434 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 FLO1YAR050W 4614 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 NET1YJL076W 3570 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.25□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 SPO71YDR104C 3738 nt3.24□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 RBK1YCR036W 1002 nt3.24□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 DLS1YJL065C 504 nt3.24□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 RPL36AYMR194W 303 nt3.24□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 DAD3YBR233W-A 285 nt3.24□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 RAD61YDR014W 1944 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 ROG1YGL144C 2058 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 NCL1YBL024W 2055 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 SMA2YML066C 1110 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 MRPL33YMR286W 261 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 GIS2YNL255C 462 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 SAR1YPL218W 573 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 REC8YPR007C 2043 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YEL025CYEL025C 3567 nt3.23□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 DOT6YER088C 2013 nt3.22□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 MCD1YDL003W 1701 nt3.22□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YHL041WYHL041W 450 nt3.22□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt3.22□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 SDH2YLL041C 801 nt3.22□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 STE6YKL209C 3873 nt3.22□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 MIT1YEL007W 2001 nt3.22□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 PTC5YOR090C 1719 nt3.22□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 TSC11YER093C 4293 nt3.22□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 SGD1YLR336C 2700 nt3.21□□□□□ -1.89
MCD1Q12158 ROM1YGR070W 3468 nt3.21□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YFH1YDL120W 525 nt3.21□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YGL041CYGL041C 204 nt3.21□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YGL069CYGL069C 465 nt3.21□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YIL032CYIL032C 357 nt3.21□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 RPS21AYKR057W 264 nt3.21□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 ABF2YMR072W 552 nt3.21□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt3.21□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 KSP1YHR082C 3090 nt3.21□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 UBP11YKR098C 2154 nt3.21□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 RPN1YHR027C 2982 nt3.21□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 POL3YDL102W 3294 nt3.2□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YPR089WYPR089W 2667 nt3.2□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 KEL2YGR238C 2649 nt3.2□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YIL059CYIL059C 366 nt3.2□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YLR294CYLR294C 330 nt3.2□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 SNQ2YDR011W 4506 nt3.2□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 FRE2YKL220C 2136 nt3.2□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 RSN1YMR266W 2862 nt3.2□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 VPS35YJL154C 2835 nt3.19□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YLR053CYLR053C 327 nt3.19□□□□□ -1.9
MCD1Q12158 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt3.19□□□□□ -1.9
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