Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 ATP3YBR039W 936 nt2.32□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 SWT1YOR166C 1377 nt2.32□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 ISW1YBR245C 3390 nt2.32□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 SDC25YLL016W 3147 nt2.31□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YSW1YBR148W 1830 nt2.31□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 RNP1YLL046C 750 nt2.31□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 LCL2YLR104W 396 nt2.31□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YOR146WYOR146W 306 nt2.31□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 BAS1YKR099W 2436 nt2.31□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 SAK1YER129W 3429 nt2.31□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 PHO2YDL106C 1680 nt2.31□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YHR078WYHR078W 1659 nt2.31□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 SIR3YLR442C 2937 nt2.31□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 GCV2YMR189W 3105 nt2.31□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.3□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.3□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 URM1YIL008W 300 nt2.3□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 LSM7YNL147W 348 nt2.3□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YOR050CYOR050C 348 nt2.3□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 ROX1YPR065W 1107 nt2.3□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 GNT1YOR320C 1476 nt2.3□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 SGM1YJR134C 2124 nt2.3□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 ORC2YBR060C 1863 nt2.29□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 IRC10YOL015W 1761 nt2.29□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 SSN2YDR443C 4263 nt2.29□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 CAJ1YER048C 1176 nt2.29□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 RPS1AYLR441C 768 nt2.29□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YMR324CYMR324C 243 nt2.29□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 SPF1YEL031W 3648 nt2.29□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 CDC24YAL041W 2565 nt2.29□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 TOP2YNL088W 4287 nt2.29□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 NUP120YKL057C 3114 nt2.28□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 RLI1YDR091C 1827 nt2.28□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 PRP6YBR055C 2700 nt2.28□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YJL070CYJL070C 2667 nt2.28□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YPR089WYPR089W 2667 nt2.28□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 IPT1YDR072C 1584 nt2.28□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 MLH1YMR167W 2310 nt2.28□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.28□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YPL238CYPL238C 390 nt2.28□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 HRD3YLR207W 2502 nt2.28□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 MSL5YLR116W 1431 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 MPH1YIR002C 2982 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 VPS64YDR200C 1815 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 snR79snR79 84 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 RTT102YGR275W 474 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 RPS20YHL015W 366 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 AYR1YIL124W 894 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YJL202CYJL202C 348 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 TMA22YJR014W 597 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YOR055WYOR055W 435 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YOR121CYOR121C 306 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YPR197CYPR197C 564 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 NAN1YPL126W 2691 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YOL098CYOL098C 3114 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 KSP1YHR082C 3090 nt2.27□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.26□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.26□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.26□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.26□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.26□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.26□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YBL071CYBL071C 309 nt2.26□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 SVL3YPL032C 2478 nt2.26□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 PRK1YIL095W 2433 nt2.26□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YER121WYER121W 345 nt2.25□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.25□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 REV1YOR346W 2958 nt2.25□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 UBP11YKR098C 2154 nt2.25□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 RRP12YPL012W 3687 nt2.24□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.24□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YDR250CYDR250C 276 nt2.24□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.24□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 PAU14YIL176C 363 nt2.24□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 PAU1YJL223C 363 nt2.24□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 GRX8YLR364W 330 nt2.24□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 RPS18BYML026C 441 nt2.24□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.24□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YJR098CYJR098C 1971 nt2.23□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 PTP3YER075C 2787 nt2.23□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 MSS11YMR164C 2277 nt2.23□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 NCL1YBL024W 2055 nt2.23□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 MZM1YDR493W 372 nt2.23□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YFR056CYFR056C 369 nt2.23□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YGR035CYGR035C 351 nt2.23□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 ACB1YGR037C 264 nt2.23□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YGR050CYGR050C 357 nt2.23□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 CRS5YOR031W 210 nt2.23□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 INP51YIL002C 2841 nt2.23□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 PTC5YOR090C 1719 nt2.22□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 LSO2YGR169C-A 279 nt2.22□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 SHE2YKL130C 741 nt2.22□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 YML003WYML003W 873 nt2.22□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 RTC6YPL183W-A 282 nt2.22□□□□□ -2.05
SSK1Q07084 VPS16YPL045W 2397 nt2.21□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 FCF2YLR051C 654 nt2.21□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.21□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YNL010WYNL010W 726 nt2.21□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YPR146CYPR146C 330 nt2.21□□□□□ -2.06
SSK1Q07084 YBR277CYBR277C 402 nt2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.1 ms