Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.46□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 CDC53YDL132W 2448 nt1.46□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 NUP82YJL061W 2142 nt1.45□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 SMD1YGR074W 441 nt1.45□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YAP3YHL009C 993 nt1.45□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 NOP10YHR072W-A 177 nt1.45□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.45□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.45□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.45□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 GRX8YLR364W 330 nt1.45□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 IRC16YPR038W 360 nt1.45□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 MGM1YOR211C 2646 nt1.45□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 CDC50YCR094W 1176 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 BNA7YDR428C 786 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 MZM1YDR493W 372 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YPS5YGL259W 498 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 VOA1YGR106C 798 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 RPL16AYIL133C 600 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 NCE101YJL205C 162 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YJR079WYJR079W 330 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YBL012CYBL012C 402 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 CTK3YML112W 891 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 SEN15YMR059W 387 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 PEX8YGR077C 1770 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 PEP1YBL017C 4740 nt1.44□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 AFI1YOR129C 2682 nt1.43□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 RTT107YHR154W 3213 nt1.43□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YGR045CYGR045C 363 nt1.43□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.43□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YLR031WYLR031W 561 nt1.43□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 MRPL44YMR225C 297 nt1.43□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YNL010WYNL010W 726 nt1.43□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.43□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 SLM6YBR266C 453 nt1.43□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 SPP41YDR464W 4308 nt1.43□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 BFA1YJR053W 1725 nt1.43□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.42□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YGR290WYGR290W 444 nt1.42□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 SNC1YAL030W 354 nt1.42□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YKL111CYKL111C 336 nt1.42□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 PKR1YMR123W 369 nt1.42□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 PBI2YNL015W 228 nt1.42□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 RPB5YBR154C 648 nt1.42□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 IST2YBR086C 2841 nt1.42□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 SPO22YIL073C 2928 nt1.42□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YJL016WYJL016W 1686 nt1.42□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 NIC96YFR002W 2520 nt1.41□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YDR286CYDR286C 345 nt1.41□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 SMB1YER029C 591 nt1.41□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 MXR1YER042W 555 nt1.41□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 IRC19YLL033W 693 nt1.41□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 RMP1YLR145W 606 nt1.41□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 GPI15YNL038W 690 nt1.41□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 YOR333CYOR333C 417 nt1.41□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 SCH9YHR205W 2475 nt1.41□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 VPS35YJL154C 2835 nt1.4□□□□□ -2.18
RDS3Q06835 BIG1YHR101C 1008 nt1.4□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 YHR130CYHR130C 336 nt1.4□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 RPC10YHR143W-A 213 nt1.4□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.4□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 ATP19YOL077W-A 207 nt1.4□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 YPL068CYPL068C 882 nt1.4□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 SET2YJL168C 2202 nt1.4□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 VPS52YDR484W 1926 nt1.4□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 TOF1YNL273W 3717 nt1.4□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 MNE1YOR350C 1992 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 SPC72YAL047C 1869 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 CRM1YGR218W 3255 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 VPH1YOR270C 2523 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 TRL1YJL087C 2484 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 SWT1YOR166C 1377 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 RPI1YIL119C 1224 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 VPS8YAL002W 3825 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 YMR324CYMR324C 243 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 NOP15YNL110C 663 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 SNC2YOR327C 348 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 RTC6YPL183W-A 282 nt1.39□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 GIP3YPL137C 3831 nt1.38□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 MEC1YBR136W 7107 nt1.38□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 RUD3YOR216C 1455 nt1.38□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 SHE9YDR393W 1371 nt1.38□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 YLR202CYLR202C 327 nt1.38□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 PET123YOR158W 957 nt1.38□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 YOR248WYOR248W 303 nt1.38□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 IRC10YOL015W 1761 nt1.38□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 RTT101YJL047C 2529 nt1.38□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.38□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 BUD2YKL092C 3315 nt1.37□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 GRR1YJR090C 3456 nt1.37□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 YDL041WYDL041W 354 nt1.37□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.37□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.37□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 HOP2YGL033W 657 nt1.37□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 COX13YGL191W 390 nt1.37□□□□□ -2.19
RDS3Q06835 FYV7YLR068W 456 nt1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.7 ms