Protein–RNA interactions for Protein: Q06333

CNL1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit CNL1, yeastyeast

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CNL1Q06333 SEC28YIL076W 891 nt0.68□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 RPC25YKL144C 639 nt0.68□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 ERP4YOR016C 624 nt0.68□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 TIM18YOR297C 579 nt0.68□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 SFG1YOR315W 1041 nt0.68□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 SHS1YDL225W 1656 nt0.68□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 POP6YGR030C 477 nt0.67□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 YKL115CYKL115C 393 nt0.67□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 RPS10BYMR230W 318 nt0.67□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 YNL179CYNL179C 438 nt0.67□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 YOL150CYOL150C 312 nt0.67□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 OST2YOR103C 393 nt0.67□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 YBR062CYBR062C 543 nt0.67□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 PAU24YBR301W 363 nt0.67□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 RTR1YER139C 681 nt0.66□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.66□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 MIC19YFR011C 513 nt0.66□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 RPL40BYKR094C 387 nt0.66□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.66□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.66□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 YCL023CYCL023C 348 nt0.66□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 YPP1YGR198W 2454 nt0.65□□□□□ -2.3
CNL1Q06333 CDC39YCR093W 6327 nt0.65□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YDR262WYDR262W 819 nt0.65□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YLR042CYLR042C 486 nt0.65□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.65□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YBL083CYBL083C 426 nt0.65□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 SEC5YDR166C 2916 nt0.65□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 SWI4YER111C 3282 nt0.64□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YCR016WYCR016W 873 nt0.64□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 SLU7YDR088C 1149 nt0.64□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YGL217CYGL217C 342 nt0.64□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YIR020CYIR020C 303 nt0.64□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YLR255CYLR255C 354 nt0.64□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 SHG1YBR258C 429 nt0.64□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 NDD1YOR372C 1665 nt0.64□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 ARP5YNL059C 2268 nt0.63□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.63□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YAP3YHL009C 993 nt0.63□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 COX8YLR395C 237 nt0.63□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 BLS1YLR408C 369 nt0.63□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.63□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 SLX4YLR135W 2247 nt0.62□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 TSA2YDR453C 591 nt0.62□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 RFA3YJL173C 369 nt0.62□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 RRI1YDL216C 1323 nt0.62□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 RAD50YNL250W 3939 nt0.61□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 MZM1YDR493W 372 nt0.61□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.61□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 ABM1YJR108W 372 nt0.61□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YOL024WYOL024W 519 nt0.61□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YBR090CYBR090C 369 nt0.61□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 NOT5YPR072W 1683 nt0.61□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 RSM28YDR494W 1086 nt0.6□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 LAG1YHL003C 1236 nt0.6□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 IST3YIR005W 447 nt0.6□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.6□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.6□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 PKR1YMR123W 369 nt0.6□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YNL010WYNL010W 726 nt0.6□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 SWS2YNL081C 432 nt0.6□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 RRP15YPR143W 753 nt0.6□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 OSH6YKR003W 1347 nt0.6□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 IML1YJR138W 4755 nt0.59□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 AIM9YER080W 1884 nt0.59□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt0.59□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 NBL1YHR199C-A 222 nt0.59□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YJR071WYJR071W 369 nt0.59□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 BRX1YOL077C 876 nt0.59□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 YBR051WYBR051W 351 nt0.59□□□□□ -2.31
CNL1Q06333 SEC1YDR164C 2175 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 VMA7YGR020C 357 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 BTN2YGR142W 1233 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 HYM1YKL189W 1200 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YLR031WYLR031W 561 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 SMD2YLR275W 333 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 URA10YMR271C 684 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 DIA1YMR316W 1011 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YNL235CYNL235C 432 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 HCH1YNL281W 462 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 GPX2YBR244W 489 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YBR287WYBR287W 1284 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YCS4YLR272C 3531 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YLL054CYLL054C 2532 nt0.58□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 PPE1YHR075C 1203 nt0.57□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YNL171CYNL171C 369 nt0.57□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 IZH4YOL101C 939 nt0.57□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.57□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 PEX34YCL056C 435 nt0.57□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 BRO1YPL084W 2535 nt0.57□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 NUP145YGL092W 3954 nt0.56□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 APL3YBL037W 3078 nt0.56□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt0.56□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 YDL009CYDL009C 324 nt0.56□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 PRM8YGL053W 714 nt0.56□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 SAY1YGR263C 1275 nt0.56□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 CGI121YML036W 546 nt0.56□□□□□ -2.32
CNL1Q06333 BI3Q0115 1554 nt0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28 ms