Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.06□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 IST3YIR005W 447 nt1.06□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 PEP8YJL053W 1140 nt1.06□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 YAR068WYAR068W 486 nt1.06□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 CMC2YBL059C-A 330 nt1.06□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 MMS22YLR320W 4365 nt1.05□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 BRO1YPL084W 2535 nt1.05□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 RAD6YGL058W 519 nt1.05□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 CWC23YGL128C 852 nt1.05□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 COX3Q0275 810 nt1.05□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 YLR031WYLR031W 561 nt1.05□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 VAM3YOR106W 852 nt1.05□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 SFB2YNL049C 2631 nt1.05□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 LAA1YJL207C 6045 nt1.05□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 RSM22YKL155C 1887 nt1.05□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 APM3YBR288C 1452 nt1.05□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 CTF4YPR135W 2784 nt1.04□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 MSH3YCR092C 3057 nt1.04□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 BST1YFL025C 3090 nt1.04□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 YDR115WYDR115W 318 nt1.04□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 YEL057CYEL057C 702 nt1.04□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt1.04□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 GPN3YLR243W 819 nt1.04□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 YHC1YLR298C 696 nt1.04□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 GAL7YBR018C 1101 nt1.04□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 NOP53YPL146C 1368 nt1.04□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 YLR422WYLR422W 5799 nt1.04□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 SAC3YDR159W 3906 nt1.03□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 snR59snR59 78 nt1.03□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 TMA20YER007C-A 546 nt1.03□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 YIL082WYIL082W 873 nt1.03□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 MCM22YJR135C 720 nt1.03□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt1.03□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt1.03□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 OST2YOR103C 393 nt1.03□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 SMC4YLR086W 4257 nt1.03□□□□□ -2.24
UPS3Q04006 DAS1YJL149W 1992 nt1.03□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 CDC27YBL084C 2277 nt1.03□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 COX1Q0045 1605 nt1.02□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YDL009CYDL009C 324 nt1.02□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 RSM18YER050C 417 nt1.02□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 SPE1YKL184W 1401 nt1.02□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 SMD3YLR147C 306 nt1.02□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 MRPS8YMR158W 468 nt1.02□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YOL106WYOL106W 354 nt1.02□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YOR105WYOR105W 327 nt1.02□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 MEI5YPL121C 669 nt1.02□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YSW1YBR148W 1830 nt1.02□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 CDC25YLR310C 4770 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 SAG1YJR004C 1953 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 MUD2YKL074C 1584 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 DAD1YDR016C 285 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 SEM1YDR363W-A 270 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 RPL29YFR032C-A 180 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YFR057WYFR057W 456 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 SPC2YML055W 537 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 BRX1YOL077C 876 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 PET123YOR158W 957 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 CDC31YOR257W 486 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 KIP1YBL063W 3336 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 ZRG8YER033C 3231 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 PMD1YER132C 5262 nt1.01□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 RIC1YLR039C 3171 nt1□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 APL1YJR005W 2103 nt1□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 IRC2YDR112W 309 nt1□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 GIC1YHR061C 945 nt1□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 TIF11YMR260C 462 nt1□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 RTC6YPL183W-A 282 nt1□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 ROX1YPR065W 1107 nt1□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 SHE4YOR035C 2370 nt0.99□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 ALK1YGL021W 2283 nt0.99□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 MZM1YDR493W 372 nt0.99□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.99□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 VOA1YGR106C 798 nt0.99□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 ACF4YJR083C 930 nt0.99□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YLR217WYLR217W 324 nt0.99□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 PGA1YNL158W 597 nt0.99□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YNL226WYNL226W 411 nt0.99□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 KAP122YGL016W 3246 nt0.99□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 NUP120YKL057C 3114 nt0.99□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YGR250CYGR250C 2346 nt0.98□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 RSM27YGR215W 333 nt0.98□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 CIC1YHR052W 1131 nt0.98□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 SNC2YOR327C 348 nt0.98□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 MSC6YOR354C 2079 nt0.98□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 CTR9YOL145C 3234 nt0.98□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 MNL2YLR057W 2550 nt0.98□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 FRK1YPL141C 2598 nt0.98□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 SPT7YBR081C 3999 nt0.97□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 TDA2YER071C 381 nt0.97□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 LAG1YHL003C 1236 nt0.97□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 LIN1YHR156C 1023 nt0.97□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YJL022WYJL022W 309 nt0.97□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt0.97□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 RPS7BYNL096C 573 nt0.97□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 YNL235CYNL235C 432 nt0.97□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 PHO80YOL001W 882 nt0.97□□□□□ -2.25
UPS3Q04006 RPL33BYOR234C 324 nt0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.8 ms