Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SIRT1Q96EB6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIRT1Q96EB6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms