Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC181Q5TID7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC181Q5TID7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms