Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIF1AQ16665 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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HIF1AQ16665 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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HIF1AQ16665 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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HIF1AQ16665 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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HIF1AQ16665 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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HIF1AQ16665 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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HIF1AQ16665 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HIF1AQ16665 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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