Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 COG4YPR105C 2586 nt0.84□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 RPS26BYER131W 360 nt0.83□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 MVB12YGR206W 306 nt0.83□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 NOP10YHR072W-A 177 nt0.83□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 BUD19YJL188C 309 nt0.83□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 TMA22YJR014W 597 nt0.83□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 YPT52YKR014C 705 nt0.83□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 CUR1YPR158W 759 nt0.83□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 YNL089CYNL089C 477 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 SFM1YOR021C 642 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 YPR063CYPR063C 423 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 AZF1YOR113W 2745 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 SPT14YPL175W 1359 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 EAF1YDR359C 2949 nt0.81□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 YDR115WYDR115W 318 nt0.81□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 INA22YIR024C 651 nt0.81□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 VPS55YJR044C 423 nt0.81□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 YAR009CYAR009C 3591 nt0.81□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 SLK19YOR195W 2466 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 UFD2YDL190C 2886 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 MVP1YMR004W 1536 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 FAR7YFR008W 666 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 COF1YLL050C 432 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 ERP4YOR016C 624 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 CLU1YMR012W 3834 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 OST1YJL002C 1431 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 MFA2YNL145W 117 nt0.79□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 CSI2YOL007C 1026 nt0.79□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 MIX23YBL107C 591 nt0.79□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 RPN8YOR261C 1017 nt0.79□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 ARL3YPL051W 597 nt0.79□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 RPN9YDR427W 1182 nt0.78□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 HTD2YHR067W 843 nt0.78□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 SNC2YOR327C 348 nt0.78□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 PAU24YBR301W 363 nt0.78□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 NUP145YGL092W 3954 nt0.78□□□□□ -2.28
RTR2Q12378 SNF5YBR289W 2718 nt0.78□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 NSE4YDL105W 1209 nt0.77□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt0.77□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YJL119CYJL119C 324 nt0.77□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 BFA1YJR053W 1725 nt0.77□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 BUD3YCL014W 4911 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 KAP120YPL125W 3099 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 DGR2YKL121W 2559 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YJL049WYJL049W 1353 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YPD1YDL235C 504 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 NUP188YML103C 4968 nt0.75□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.75□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.75□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YGL177WYGL177W 348 nt0.75□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt0.75□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 RRT16YNL105W 429 nt0.75□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 OST2YOR103C 393 nt0.75□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 CIN2YPL241C 807 nt0.75□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 PAU2YEL049W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 PAU12YGR294W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 RPI1YIL119C 1224 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 PHS1YJL097W 654 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YET1YKL065C 621 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 HSK3YKL138C-A 210 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 PAU18YLL064C 363 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 PAU6YNR076W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 CDC5YMR001C 2118 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 SAS3YBL052C 2496 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 APL3YBL037W 3078 nt0.73□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 NCL1YBL024W 2055 nt0.73□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YDL157CYDL157C 357 nt0.73□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 FIP1YJR093C 984 nt0.73□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 VID24YBR105C 1089 nt0.73□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 MUK1YPL070W 1839 nt0.73□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 ZRG8YER033C 3231 nt0.72□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YJR003CYJR003C 1560 nt0.72□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YDR199WYDR199W 366 nt0.72□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YIP1YGR172C 747 nt0.72□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 TEX1YNL253W 1269 nt0.72□□□□□ -2.29
RTR2Q12378 YGR250CYGR250C 2346 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YCR090CYCR090C 549 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 OST5YGL226C-A 261 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 LSM7YNL147W 348 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YNL226WYNL226W 411 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 ECM25YJL201W 1800 nt0.71□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 DAS1YJL149W 1992 nt0.7□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 MEI4YER044C-A 1227 nt0.7□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.8 ms