Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YJR087WYJR087W 351 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 NBP1YLR457C 960 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 TOA1YOR194C 861 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YOR333CYOR333C 417 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 AGC1YPR021C 2709 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 SPO22YIL073C 2928 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 PEX8YGR077C 1770 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 AHC2YCR082W 387 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 snR9snR9 187 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YER038W-AYER038W-A 381 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 SMD1YGR074W 441 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YGR228WYGR228W 345 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 TPM2YIL138C 486 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 SNC1YAL030W 354 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YHC1YLR298C 696 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YMR254CYMR254C 309 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 LRE1YCL051W 1752 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 MYO2YOR326W 4725 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 ATG9YDL149W 2994 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 BRO1YPL084W 2535 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 NCL1YBL024W 2055 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 BFA1YJR053W 1725 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 BET4YJL031C 984 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 ARV1YLR242C 966 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YOL029CYOL029C 606 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YOR392WYOR392W 444 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 VPH1YOR270C 2523 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 PDR8YLR266C 2106 nt1.78□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 VPS8YAL002W 3825 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 PRP21YJL203W 843 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 CMS1YLR003C 876 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 TMA7YLR262C-A 195 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YOR105WYOR105W 327 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 CSM4YPL200W 471 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YJL070CYJL070C 2667 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 NIC96YFR002W 2520 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 MNE1YOR350C 1992 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YMR045CYMR045C 5268 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 TRL1YJL087C 2484 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 RRI2YOL117W 1938 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YEL057CYEL057C 702 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 HOP2YGL033W 657 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 SCEIQ0160 708 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YLR053CYLR053C 327 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 ATP15YPL271W 189 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 DPB11YJL090C 2295 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 REF2YDR195W 1602 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 RTT101YJL047C 2529 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 DFG16YOR030W 1860 nt1.75□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 SPE1YKL184W 1401 nt1.75□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YDL187CYDL187C 330 nt1.75□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YDR018CYDR018C 1191 nt1.75□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.75□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 COX13YGL191W 390 nt1.75□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 GRX8YLR364W 330 nt1.75□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 KAP123YER110C 3342 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 CDC50YCR094W 1176 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 UBC5YDR059C 447 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YDR286CYDR286C 345 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YGR283CYGR283C 1026 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 AIM18YHR198C 966 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 RPI1YIL119C 1224 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 RLP24YLR009W 600 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YPL080CYPL080C 327 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 RPB5YBR154C 648 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 RNH70YGR276C 1662 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 RNR4YGR180C 1038 nt1.73□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 RPB11YOL005C 363 nt1.73□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YOR152CYOR152C 771 nt1.73□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 IRC20YLR247C 4671 nt1.73□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 MMS22YLR320W 4365 nt1.73□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 CFT2YLR115W 2580 nt1.73□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 RTP1YMR185W 2946 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 IRC4YDR540C 540 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 YIR020CYIR020C 303 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 RCN1YKL159C 636 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 URA10YMR271C 684 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 RPS7BYNL096C 573 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 ROX1YPR065W 1107 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP42Q12277 MDM32YOR147W 1869 nt1.71□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 APM3YBR288C 1452 nt1.71□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.71□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YPR096CYPR096C 303 nt1.71□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YPR172WYPR172W 603 nt1.71□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 SPC72YAL047C 1869 nt1.71□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 LHS1YKL073W 2646 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 VPS35YJL154C 2835 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 RPL37BYDR500C 267 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 VMA21YGR105W 234 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP42Q12277 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.7□□□□□ -2.14
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