Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 LAG1YHL003C 1236 nt2.16□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 TIM8YJR135W-A 264 nt2.16□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 YLR458WYLR458W 381 nt2.16□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 RPS17AYML024W 411 nt2.16□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 URA10YMR271C 684 nt2.16□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 IGO1YNL157W 507 nt2.16□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 ATX2YOR079C 942 nt2.16□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 REV1YOR346W 2958 nt2.16□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 SMC6YLR383W 3345 nt2.16□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 CLN3YAL040C 1743 nt2.16□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 TAE2YPL009C 3117 nt2.15□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 BRE1YDL074C 2103 nt2.15□□□□□ -2.06
RUP1Q12242 UBP11YKR098C 2154 nt2.15□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 HNT1YDL125C 477 nt2.15□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YRB1YDR002W 606 nt2.15□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 RPS24AYER074W 408 nt2.15□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YGR290WYGR290W 444 nt2.15□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.15□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 RRP6YOR001W 2202 nt2.15□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 RGL1YPL066W 1440 nt2.15□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 CHC1YGL206C 4962 nt2.15□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 BRO1YPL084W 2535 nt2.14□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.14□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 MET32YDR253C 576 nt2.14□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 CMS1YLR003C 876 nt2.14□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 ICY1YMR195W 384 nt2.14□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 DGK1YOR311C 873 nt2.14□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 SVS1YPL163C 783 nt2.14□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 IRC16YPR038W 360 nt2.14□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 MGR1YCL044C 1254 nt2.14□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 GCN2YDR283C 4980 nt2.14□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 GIS1YDR096W 2685 nt2.14□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 UTP13YLR222C 2454 nt2.13□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 SPR3YGR059W 1539 nt2.13□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.13□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YFH1YDL120W 525 nt2.13□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 VTC1YER072W 390 nt2.13□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 TMA10YLR327C 261 nt2.13□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 RPB11YOL005C 363 nt2.13□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YOR105WYOR105W 327 nt2.13□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 Q0017Q0017 162 nt2.13□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 BFA1YJR053W 1725 nt2.13□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 SAP190YKR028W 3102 nt2.13□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 TRS130YMR218C 3309 nt2.12□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 MDM32YOR147W 1869 nt2.12□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 NAN1YPL126W 2691 nt2.12□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YFR056CYFR056C 369 nt2.12□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.12□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 EAF6YJR082C 342 nt2.12□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 RPL37AYLR185W 267 nt2.12□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 MRPL44YMR225C 297 nt2.12□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 RSA1YPL193W 1146 nt2.12□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YPL197CYPL197C 414 nt2.12□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YEL043WYEL043W 2871 nt2.12□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 BNA7YDR428C 786 nt2.11□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 RPL9AYGL147C 576 nt2.11□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 SNC1YAL030W 354 nt2.11□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 PKR1YMR123W 369 nt2.11□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 GPI15YNL038W 690 nt2.11□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YBL108WYBL108W 306 nt2.11□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 SSY1YDR160W 2559 nt2.11□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 INO80YGL150C 4470 nt2.11□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 RTR2YDR066C 591 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YPS5YGL259W 498 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 NOP10YHR072W-A 177 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 KOG1YHR186C 4674 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 MPH1YIR002C 2982 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 NCE101YJL205C 162 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YJR079WYJR079W 330 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 VTI1YMR197C 654 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 PTC5YOR090C 1719 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 NUP100YKL068W 2880 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 NCL1YBL024W 2055 nt2.1□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 NUP82YJL061W 2142 nt2.09□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 MSL5YLR116W 1431 nt2.09□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 BPH1YCR032W 6504 nt2.09□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 FMP16YDR070C 282 nt2.09□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.09□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 SPC1YJR010C-A 285 nt2.09□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 RMP1YLR145W 606 nt2.09□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 CTK3YML112W 891 nt2.09□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 DDR48YMR173W 1293 nt2.09□□□□□ -2.07
RUP1Q12242 IPT1YDR072C 1584 nt2.09□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.09□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 UBP2YOR124C 3819 nt2.09□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 UFD4YKL010C 4452 nt2.09□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 YJL070CYJL070C 2667 nt2.08□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 GCN4YEL009C 846 nt2.08□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 YAP3YHL009C 993 nt2.08□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 RPC10YHR143W-A 213 nt2.08□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.08□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 FYV7YLR068W 456 nt2.08□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 UTP22YGR090W 3714 nt2.08□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 YDL118WYDL118W 381 nt2.07□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.07□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 YMR324CYMR324C 243 nt2.07□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.07□□□□□ -2.08
RUP1Q12242 FKS1YLR342W 5631 nt2.06□□□□□ -2.08
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