Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 YER160CYER160C 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YJR027WYJR027W 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YML039WYML039W 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YML045WYML045W 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YMR050CYMR050C 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 NFT1YKR103W 3657 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 SKP2YNL311C 2292 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 BRO1YPL084W 2535 nt2.4□□□□□ -2.02
SSK1Q07084 GPI8YDR331W 1236 nt2.4□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YER189WYER189W 369 nt2.4□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.4□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YDR239CYDR239C 2364 nt2.4□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 NAB3YPL190C 2409 nt2.4□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 TPS2YDR074W 2691 nt2.4□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 DNL4YOR005C 2835 nt2.4□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YPK1YKL126W 2043 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 RPO41YFL036W 4056 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 snR76snR76 109 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 ATP17YDR377W 306 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 ERP6YGL002W 651 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 RPL40AYIL148W 387 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 SEC22YLR268W 645 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YLR434CYLR434C 384 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YLR458WYLR458W 381 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 BSC3YLR465C 309 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YML037CYML037C 1023 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 NUP82YJL061W 2142 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 SPC72YAL047C 1869 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 RUD3YOR216C 1455 nt2.39□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 SWR1YDR334W 4545 nt2.38□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 TRA1YHR099W 11235 nt2.38□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 DBP10YDL031W 2988 nt2.38□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 DAS1YJL149W 1992 nt2.38□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YAP6YDR259C 1152 nt2.38□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 AAD16YFL057C 459 nt2.38□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 RPS24BYIL069C 408 nt2.38□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YJL181WYJL181W 1836 nt2.38□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 MKT1YNL085W 2493 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 MRD1YPR112C 2664 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 FIR1YER032W 2631 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 DUG2YBR281C 2637 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YDL068WYDL068W 330 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 HYP2YEL034W 474 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 CCW14YLR390W-A 717 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 PRE8YML092C 753 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 FPR1YNL135C 345 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 MRPL50YNR022C 420 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YPL185WYPL185W 396 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 ACM1YPL267W 630 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 GPX2YBR244W 489 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 MGR1YCL044C 1254 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 SNX41YDR425W 1878 nt2.37□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 AYT1YLL063C 1425 nt2.36□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 GCD10YNL062C 1437 nt2.36□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.36□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.36□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 RPS22BYLR367W 393 nt2.36□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 COX7YMR256C 183 nt2.36□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 PSK2YOL045W 3306 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YBT1YLL048C 4986 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YJL016WYJL016W 1686 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 VPS52YDR484W 1926 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 VPS13YLL040C 9435 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 CSF1YLR087C 8877 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 RTR1YER139C 681 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 RAM2YKL019W 951 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YLR287CYLR287C 1068 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 RPL36AYMR194W 303 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 EGD1YPL037C 474 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YBR197CYBR197C 654 nt2.35□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YEF3YLR249W 3135 nt2.34□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YDL041WYDL041W 354 nt2.34□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 HIT1YJR055W 495 nt2.34□□□□□ -2.03
SSK1Q07084 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.34□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YKU80YMR106C 1890 nt2.33□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 RSE1YML049C 4086 nt2.33□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 RGA2YDR379W 3030 nt2.33□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YPL150WYPL150W 2706 nt2.33□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.33□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 VOA1YGR106C 798 nt2.33□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YLR031WYLR031W 561 nt2.33□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 KTI11YBL071W-A 249 nt2.33□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 RPS12YOR369C 432 nt2.33□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 ARP8YOR141C 2646 nt2.33□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 DIE2YGR227W 1578 nt2.32□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 COX1Q0045 1605 nt2.32□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 SMY2YBR172C 2223 nt2.32□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 ORC1YML065W 2745 nt2.32□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 PDR1YGL013C 3207 nt2.32□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 YNL058CYNL058C 951 nt2.32□□□□□ -2.04
SSK1Q07084 COQ10YOL008W 624 nt2.32□□□□□ -2.04
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