Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC63Q05C16 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC63Q05C16 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms