Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 NSE3YDR288W 912 nt0.38□□□□□ -2.35
SSK2P53599 RGM1YMR182C 636 nt0.38□□□□□ -2.35
SSK2P53599 SHR3YDL212W 633 nt0.37□□□□□ -2.35
SSK2P53599 TAD1YGL243W 1203 nt0.37□□□□□ -2.35
SSK2P53599 UPS2YLR168C 693 nt0.37□□□□□ -2.35
SSK2P53599 YMR144WYMR144W 1029 nt0.37□□□□□ -2.35
SSK2P53599 MYO1YHR023W 5787 nt0.37□□□□□ -2.35
SSK2P53599 PEX27YOR193W 1131 nt0.36□□□□□ -2.35
SSK2P53599 APD1YBR151W 951 nt0.36□□□□□ -2.35
SSK2P53599 RRP6YOR001W 2202 nt0.36□□□□□ -2.35
SSK2P53599 TRM2YKR056W 1920 nt0.36□□□□□ -2.35
SSK2P53599 PEX34YCL056C 435 nt0.36□□□□□ -2.35
SSK2P53599 HSE1YHL002W 1359 nt0.35□□□□□ -2.35
SSK2P53599 YAR053WYAR053W 297 nt0.35□□□□□ -2.35
SSK2P53599 FUS1YCL027W 1539 nt0.35□□□□□ -2.35
SSK2P53599 PXA2YKL188C 2562 nt0.34□□□□□ -2.35
SSK2P53599 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.34□□□□□ -2.36
SSK2P53599 OMA1YKR087C 1038 nt0.34□□□□□ -2.36
SSK2P53599 RPL38YLR325C 237 nt0.34□□□□□ -2.36
SSK2P53599 YMR324CYMR324C 243 nt0.34□□□□□ -2.36
SSK2P53599 ATG5YPL149W 885 nt0.34□□□□□ -2.36
SSK2P53599 RTG3YBL103C 1461 nt0.34□□□□□ -2.36
SSK2P53599 NCA2YPR155C 1851 nt0.34□□□□□ -2.36
SSK2P53599 YDR340WYDR340W 303 nt0.33□□□□□ -2.36
SSK2P53599 ESP1YGR098C 4893 nt0.33□□□□□ -2.36
SSK2P53599 SRN2YLR119W 642 nt0.32□□□□□ -2.36
SSK2P53599 BAG7YOR134W 1230 nt0.32□□□□□ -2.36
SSK2P53599 MPD1YOR288C 957 nt0.32□□□□□ -2.36
SSK2P53599 AIM9YER080W 1884 nt0.32□□□□□ -2.36
SSK2P53599 NBP1YLR457C 960 nt0.32□□□□□ -2.36
SSK2P53599 ASM4YDL088C 1587 nt0.31□□□□□ -2.36
SSK2P53599 snR76snR76 109 nt0.31□□□□□ -2.36
SSK2P53599 EDC1YGL222C 528 nt0.31□□□□□ -2.36
SSK2P53599 USV1YPL230W 1176 nt0.31□□□□□ -2.36
SSK2P53599 YPR148CYPR148C 1308 nt0.3□□□□□ -2.36
SSK2P53599 ULI1YFR026C 510 nt0.3□□□□□ -2.36
SSK2P53599 URB1YKL014C 5295 nt0.3□□□□□ -2.36
SSK2P53599 DGR2YKL121W 2559 nt0.3□□□□□ -2.36
SSK2P53599 RSM26YJR101W 801 nt0.29□□□□□ -2.36
SSK2P53599 MMF1YIL051C 438 nt0.28□□□□□ -2.36
SSK2P53599 YLR444CYLR444C 303 nt0.28□□□□□ -2.36
SSK2P53599 HHT1YBR010W 411 nt0.28□□□□□ -2.36
SSK2P53599 MSS2YDL107W 1056 nt0.28□□□□□ -2.37
SSK2P53599 VPS55YJR044C 423 nt0.28□□□□□ -2.37
SSK2P53599 MUM3YOR298W 1440 nt0.27□□□□□ -2.37
SSK2P53599 TEN1YLR010C 483 nt0.27□□□□□ -2.37
SSK2P53599 YLL007CYLL007C 1998 nt0.27□□□□□ -2.37
SSK2P53599 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.26□□□□□ -2.37
SSK2P53599 RGI2YIL057C 495 nt0.26□□□□□ -2.37
SSK2P53599 YJL022WYJL022W 309 nt0.26□□□□□ -2.37
SSK2P53599 GMC2YLR445W 567 nt0.26□□□□□ -2.37
SSK2P53599 ERD2YBL040C 660 nt0.26□□□□□ -2.37
SSK2P53599 TOA1YOR194C 861 nt0.26□□□□□ -2.37
SSK2P53599 MNE1YOR350C 1992 nt0.26□□□□□ -2.37
SSK2P53599 ALK1YGL021W 2283 nt0.25□□□□□ -2.37
SSK2P53599 POP8YBL018C 402 nt0.25□□□□□ -2.37
SSK2P53599 snR13snR13 124 nt0.25□□□□□ -2.37
SSK2P53599 YBR277CYBR277C 402 nt0.25□□□□□ -2.37
SSK2P53599 CLB5YPR120C 1308 nt0.25□□□□□ -2.37
SSK2P53599 HDA3YPR179C 1968 nt0.25□□□□□ -2.37
SSK2P53599 MVP1YMR004W 1536 nt0.24□□□□□ -2.37
SSK2P53599 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt0.24□□□□□ -2.37
SSK2P53599 GIC1YHR061C 945 nt0.24□□□□□ -2.37
SSK2P53599 APC2YLR127C 2562 nt0.24□□□□□ -2.37
SSK2P53599 COX1Q0045 1605 nt0.24□□□□□ -2.37
SSK2P53599 YJL211CYJL211C 444 nt0.23□□□□□ -2.37
SSK2P53599 WHI3YNL197C 1986 nt0.23□□□□□ -2.37
SSK2P53599 DUO1YGL061C 744 nt0.23□□□□□ -2.37
SSK2P53599 YIL161WYIL161W 708 nt0.23□□□□□ -2.37
SSK2P53599 MRPL50YNR022C 420 nt0.23□□□□□ -2.37
SSK2P53599 YET2YMR040W 483 nt0.22□□□□□ -2.37
SSK2P53599 YNL010WYNL010W 726 nt0.22□□□□□ -2.37
SSK2P53599 snR11snR11 258 nt0.22□□□□□ -2.37
SSK2P53599 SLF1YDR515W 1344 nt0.22□□□□□ -2.37
SSK2P53599 AZF1YOR113W 2745 nt0.21□□□□□ -2.38
SSK2P53599 RPL32YBL092W 393 nt0.21□□□□□ -2.38
SSK2P53599 YNR068CYNR068C 819 nt0.21□□□□□ -2.38
SSK2P53599 PRK1YIL095W 2433 nt0.21□□□□□ -2.38
SSK2P53599 SGO1YOR073W 1773 nt0.2□□□□□ -2.38
SSK2P53599 CSI2YOL007C 1026 nt0.2□□□□□ -2.38
SSK2P53599 RRP15YPR143W 753 nt0.2□□□□□ -2.38
SSK2P53599 CRM1YGR218W 3255 nt0.2□□□□□ -2.38
SSK2P53599 YGR250CYGR250C 2346 nt0.2□□□□□ -2.38
SSK2P53599 YDL206WYDL206W 2289 nt0.2□□□□□ -2.38
SSK2P53599 SMB1YER029C 591 nt0.19□□□□□ -2.38
SSK2P53599 RSM27YGR215W 333 nt0.19□□□□□ -2.38
SSK2P53599 KEG1YFR042W 603 nt0.19□□□□□ -2.38
SSK2P53599 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.18□□□□□ -2.38
SSK2P53599 VPS74YDR372C 1038 nt0.18□□□□□ -2.38
SSK2P53599 YJL007CYJL007C 315 nt0.18□□□□□ -2.38
SSK2P53599 ABF2YMR072W 552 nt0.18□□□□□ -2.38
SSK2P53599 YNL228WYNL228W 777 nt0.18□□□□□ -2.38
SSK2P53599 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.17□□□□□ -2.38
SSK2P53599 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.17□□□□□ -2.38
SSK2P53599 NOP53YPL146C 1368 nt0.17□□□□□ -2.38
SSK2P53599 SPC1YJR010C-A 285 nt0.16□□□□□ -2.38
SSK2P53599 PRM9YAR031W 897 nt0.16□□□□□ -2.38
SSK2P53599 GRX7YBR014C 612 nt0.16□□□□□ -2.38
SSK2P53599 RPS24BYIL069C 408 nt0.15□□□□□ -2.39
SSK2P53599 EMC2YJR088C 879 nt0.14□□□□□ -2.39
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