Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 YMR320WYMR320W 306 nt2.36□□□□□ -2.03
NDI1P32340 RPB11YOL005C 363 nt2.36□□□□□ -2.03
NDI1P32340 FYV12YOR183W 390 nt2.36□□□□□ -2.03
NDI1P32340 ATP3YBR039W 936 nt2.36□□□□□ -2.03
NDI1P32340 VTC3YPL019C 2508 nt2.36□□□□□ -2.03
NDI1P32340 PPN1YDR452W 2025 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 PHO2YDL106C 1680 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 YHR125WYHR125W 306 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 YLR101CYLR101C 396 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 YLR269CYLR269C 351 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 CMC2YBL059C-A 330 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 YPL197CYPL197C 414 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 MSS18YPR134W 807 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 SPF1YEL031W 3648 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 OSW7YFR039C 1533 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 SCP160YJL080C 3669 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 SLN1YIL147C 3663 nt2.35□□□□□ -2.03
NDI1P32340 CSF1YLR087C 8877 nt2.34□□□□□ -2.03
NDI1P32340 ROY1YMR258C 1662 nt2.34□□□□□ -2.03
NDI1P32340 RGA2YDR379W 3030 nt2.34□□□□□ -2.03
NDI1P32340 EDS1YBR033W 2760 nt2.34□□□□□ -2.03
NDI1P32340 snR56snR56 88 nt2.34□□□□□ -2.03
NDI1P32340 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.34□□□□□ -2.03
NDI1P32340 HSC82YMR186W 2118 nt2.34□□□□□ -2.03
NDI1P32340 TIF11YMR260C 462 nt2.34□□□□□ -2.03
NDI1P32340 MDM32YOR147W 1869 nt2.34□□□□□ -2.03
NDI1P32340 SAK1YER129W 3429 nt2.34□□□□□ -2.04
NDI1P32340 NDD1YOR372C 1665 nt2.34□□□□□ -2.04
NDI1P32340 ECM5YMR176W 4236 nt2.33□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.33□□□□□ -2.04
NDI1P32340 TPM2YIL138C 486 nt2.33□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.33□□□□□ -2.04
NDI1P32340 PSY1YKL076C 384 nt2.33□□□□□ -2.04
NDI1P32340 RPL37AYLR185W 267 nt2.33□□□□□ -2.04
NDI1P32340 URA10YMR271C 684 nt2.33□□□□□ -2.04
NDI1P32340 RSA1YPL193W 1146 nt2.33□□□□□ -2.04
NDI1P32340 BAS1YKR099W 2436 nt2.33□□□□□ -2.04
NDI1P32340 SPO23YBR250W 1572 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 RNH70YGR276C 1662 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YDR157WYDR157W 402 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 ACB1YGR037C 264 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 TWF1YGR080W 999 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 PAU14YIL176C 363 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 PAU1YJL223C 363 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 PET191YJR034W 327 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 TEN1YLR010C 483 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 AIM32YML050W 936 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 SEN15YMR059W 387 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 DGK1YOR311C 873 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 BNI1YNL271C 5862 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 UBP15YMR304W 3693 nt2.32□□□□□ -2.04
NDI1P32340 VPS13YLL040C 9435 nt2.31□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YGL165CYGL165C 579 nt2.31□□□□□ -2.04
NDI1P32340 RPS7BYNL096C 573 nt2.31□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YOR248WYOR248W 303 nt2.31□□□□□ -2.04
NDI1P32340 LEE1YPL054W 906 nt2.31□□□□□ -2.04
NDI1P32340 LEU3YLR451W 2661 nt2.31□□□□□ -2.04
NDI1P32340 SNX41YDR425W 1878 nt2.31□□□□□ -2.04
NDI1P32340 APL5YPL195W 2799 nt2.3□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YRB1YDR002W 606 nt2.3□□□□□ -2.04
NDI1P32340 NBL1YHR199C-A 222 nt2.3□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YIL058WYIL058W 285 nt2.3□□□□□ -2.04
NDI1P32340 TIM8YJR135W-A 264 nt2.3□□□□□ -2.04
NDI1P32340 SIP18YMR175W 240 nt2.3□□□□□ -2.04
NDI1P32340 TRM7YBR061C 933 nt2.3□□□□□ -2.04
NDI1P32340 PSO2YMR137C 1986 nt2.3□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YPR089WYPR089W 2667 nt2.3□□□□□ -2.04
NDI1P32340 PRP6YBR055C 2700 nt2.3□□□□□ -2.04
NDI1P32340 CBF2YGR140W 2871 nt2.29□□□□□ -2.04
NDI1P32340 SSE1YPL106C 2082 nt2.29□□□□□ -2.04
NDI1P32340 ECM25YJL201W 1800 nt2.29□□□□□ -2.04
NDI1P32340 TIM9YEL020W-A 264 nt2.29□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YER135CYER135C 393 nt2.29□□□□□ -2.04
NDI1P32340 PEX4YGR133W 552 nt2.29□□□□□ -2.04
NDI1P32340 HYR1YIR037W 492 nt2.29□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.29□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.29□□□□□ -2.04
NDI1P32340 RPL25YOL127W 429 nt2.29□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YPR012WYPR012W 255 nt2.29□□□□□ -2.04
NDI1P32340 RAV1YJR033C 4074 nt2.28□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YER079WYER079W 633 nt2.28□□□□□ -2.04
NDI1P32340 IES5YER092W 378 nt2.28□□□□□ -2.04
NDI1P32340 CRG1YHR209W 876 nt2.28□□□□□ -2.04
NDI1P32340 PAU8YAL068C 363 nt2.28□□□□□ -2.04
NDI1P32340 CDC33YOL139C 642 nt2.28□□□□□ -2.04
NDI1P32340 PAU20YOL161C 363 nt2.28□□□□□ -2.04
NDI1P32340 ATP15YPL271W 189 nt2.28□□□□□ -2.04
NDI1P32340 YBR197CYBR197C 654 nt2.28□□□□□ -2.04
NDI1P32340 SSD1YDR293C 3753 nt2.28□□□□□ -2.04
NDI1P32340 SEC16YPL085W 6588 nt2.27□□□□□ -2.05
NDI1P32340 SMC6YLR383W 3345 nt2.27□□□□□ -2.05
NDI1P32340 DNF1YER166W 4716 nt2.27□□□□□ -2.05
NDI1P32340 INP53YOR109W 3324 nt2.27□□□□□ -2.05
NDI1P32340 SDC1YDR469W 528 nt2.27□□□□□ -2.05
NDI1P32340 Q0142Q0142 177 nt2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms