Protein–RNA interactions for Protein: P21538

REB1, DNA-binding protein REB1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REB1P21538 TMA19YKL056C 504 nt5.8□□□□□ -1.48
REB1P21538 YBR174CYBR174C 315 nt5.8□□□□□ -1.48
REB1P21538 MSC7YHR039C 1935 nt5.8□□□□□ -1.48
REB1P21538 VPS53YJL029C 2469 nt5.8□□□□□ -1.48
REB1P21538 RAD53YPL153C 2466 nt5.8□□□□□ -1.48
REB1P21538 YGL024WYGL024W 336 nt5.79□□□□□ -1.48
REB1P21538 YGL069CYGL069C 465 nt5.79□□□□□ -1.48
REB1P21538 HPF1YOL155C 2904 nt5.79□□□□□ -1.48
REB1P21538 ROG3YFR022W 2202 nt5.78□□□□□ -1.48
REB1P21538 YGR237CYGR237C 2358 nt5.78□□□□□ -1.48
REB1P21538 YLR296WYLR296W 327 nt5.78□□□□□ -1.48
REB1P21538 CFT2YLR115W 2580 nt5.78□□□□□ -1.48
REB1P21538 RNR3YIL066C 2610 nt5.78□□□□□ -1.48
REB1P21538 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt5.77□□□□□ -1.49
REB1P21538 RAM2YKL019W 951 nt5.77□□□□□ -1.49
REB1P21538 KIC1YHR102W 3243 nt5.76□□□□□ -1.49
REB1P21538 SOM1YEL059C-A 225 nt5.76□□□□□ -1.49
REB1P21538 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt5.76□□□□□ -1.49
REB1P21538 ACE2YLR131C 2313 nt5.76□□□□□ -1.49
REB1P21538 YNL034WYNL034W 1839 nt5.76□□□□□ -1.49
REB1P21538 ATG26YLR189C 3597 nt5.76□□□□□ -1.49
REB1P21538 CHL1YPL008W 2586 nt5.75□□□□□ -1.49
REB1P21538 ROD1YOR018W 2514 nt5.75□□□□□ -1.49
REB1P21538 HUL4YJR036C 2679 nt5.75□□□□□ -1.49
REB1P21538 YDL118WYDL118W 381 nt5.74□□□□□ -1.49
REB1P21538 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt5.74□□□□□ -1.49
REB1P21538 ALO1YML086C 1581 nt5.74□□□□□ -1.49
REB1P21538 NAB3YPL190C 2409 nt5.74□□□□□ -1.49
REB1P21538 MET4YNL103W 2019 nt5.74□□□□□ -1.49
REB1P21538 AHC1YOR023C 1701 nt5.74□□□□□ -1.49
REB1P21538 FRE2YKL220C 2136 nt5.73□□□□□ -1.49
REB1P21538 YCL046WYCL046W 324 nt5.73□□□□□ -1.49
REB1P21538 HAP1YLR256W 4509 nt5.72□□□□□ -1.49
REB1P21538 MPS1YDL028C 2295 nt5.72□□□□□ -1.49
REB1P21538 VTC4YJL012C 2166 nt5.72□□□□□ -1.49
REB1P21538 MUS81YDR386W 1899 nt5.72□□□□□ -1.49
REB1P21538 MPT5YGL178W 2580 nt5.71□□□□□ -1.49
REB1P21538 UPC2YDR213W 2742 nt5.71□□□□□ -1.49
REB1P21538 VID28YIL017C 2766 nt5.71□□□□□ -1.5
REB1P21538 RNR1YER070W 2667 nt5.71□□□□□ -1.5
REB1P21538 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt5.71□□□□□ -1.5
REB1P21538 COA3YJL062W-A 258 nt5.71□□□□□ -1.5
REB1P21538 SOD1YJR104C 465 nt5.71□□□□□ -1.5
REB1P21538 CYK3YDL117W 2658 nt5.71□□□□□ -1.5
REB1P21538 SNU114YKL173W 3027 nt5.7□□□□□ -1.5
REB1P21538 CDC20YGL116W 1833 nt5.7□□□□□ -1.5
REB1P21538 NOC3YLR002C 1992 nt5.7□□□□□ -1.5
REB1P21538 CDC31YOR257W 486 nt5.7□□□□□ -1.5
REB1P21538 KAR2YJL034W 2049 nt5.7□□□□□ -1.5
REB1P21538 URB2YJR041C 3525 nt5.7□□□□□ -1.5
REB1P21538 VTH1YIL173W 4650 nt5.69□□□□□ -1.5
REB1P21538 VTH2YJL222W 4650 nt5.69□□□□□ -1.5
REB1P21538 NCA2YPR155C 1851 nt5.69□□□□□ -1.5
REB1P21538 SNA2YDR525W-A 240 nt5.69□□□□□ -1.5
REB1P21538 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt5.69□□□□□ -1.5
REB1P21538 FMP46YKR049C 402 nt5.69□□□□□ -1.5
REB1P21538 GRX8YLR364W 330 nt5.69□□□□□ -1.5
REB1P21538 YMR324CYMR324C 243 nt5.69□□□□□ -1.5
REB1P21538 ROT2YBR229C 2865 nt5.69□□□□□ -1.5
REB1P21538 YDL242WYDL242W 354 nt5.68□□□□□ -1.5
REB1P21538 ECM5YMR176W 4236 nt5.68□□□□□ -1.5
REB1P21538 APL5YPL195W 2799 nt5.68□□□□□ -1.5
REB1P21538 KGD1YIL125W 3045 nt5.68□□□□□ -1.5
REB1P21538 TUP1YCR084C 2142 nt5.68□□□□□ -1.5
REB1P21538 ECM16YMR128W 3804 nt5.67□□□□□ -1.5
REB1P21538 YOR019WYOR019W 2193 nt5.67□□□□□ -1.5
REB1P21538 PXA1YPL147W 2613 nt5.67□□□□□ -1.5
REB1P21538 SSB2YNL209W 1842 nt5.67□□□□□ -1.5
REB1P21538 MNN4YKL201C 3537 nt5.66□□□□□ -1.5
REB1P21538 ZIP2YGL249W 2115 nt5.66□□□□□ -1.5
REB1P21538 MDV1YJL112W 2145 nt5.66□□□□□ -1.5
REB1P21538 KAR3YPR141C 2190 nt5.66□□□□□ -1.5
REB1P21538 PSE1YMR308C 3270 nt5.66□□□□□ -1.5
REB1P21538 ALK2YBL009W 2031 nt5.66□□□□□ -1.5
REB1P21538 GCN20YFR009W 2259 nt5.65□□□□□ -1.5
REB1P21538 RIX1YHR197W 2292 nt5.65□□□□□ -1.51
REB1P21538 YPR003CYPR003C 2265 nt5.65□□□□□ -1.51
REB1P21538 PTC5YOR090C 1719 nt5.65□□□□□ -1.51
REB1P21538 EPS1YIL005W 2106 nt5.65□□□□□ -1.51
REB1P21538 GDB1YPR184W 4611 nt5.65□□□□□ -1.51
REB1P21538 MCD4YKL165C 2760 nt5.64□□□□□ -1.51
REB1P21538 SKT5YBL061C 2091 nt5.64□□□□□ -1.51
REB1P21538 YDL176WYDL176W 2127 nt5.64□□□□□ -1.51
REB1P21538 YPL044CYPL044C 549 nt5.64□□□□□ -1.51
REB1P21538 CTF4YPR135W 2784 nt5.64□□□□□ -1.51
REB1P21538 GCR1YPL075W 2358 nt5.64□□□□□ -1.51
REB1P21538 TIM11YDR322C-A 291 nt5.63□□□□□ -1.51
REB1P21538 HOS4YIL112W 3252 nt5.63□□□□□ -1.51
REB1P21538 KHA1YJL094C 2622 nt5.63□□□□□ -1.51
REB1P21538 RIA1YNL163C 3333 nt5.63□□□□□ -1.51
REB1P21538 YOR1YGR281W 4434 nt5.62□□□□□ -1.51
REB1P21538 snR81snR81 201 nt5.62□□□□□ -1.51
REB1P21538 YNL144CYNL144C 2223 nt5.62□□□□□ -1.51
REB1P21538 LEU3YLR451W 2661 nt5.61□□□□□ -1.51
REB1P21538 YBL065WYBL065W 345 nt5.61□□□□□ -1.51
REB1P21538 SEC63YOR254C 1992 nt5.61□□□□□ -1.51
REB1P21538 FLO8YER109C 2400 nt5.6□□□□□ -1.51
REB1P21538 YDL196WYDL196W 330 nt5.59□□□□□ -1.51
REB1P21538 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt5.59□□□□□ -1.51
REB1P21538 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.8 ms