RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: P20485
CKI1, Choline kinase, yeast
Predictions only
Length
582 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
CKI1
P20485
REV1
YOR346W
2958 nt
2.01
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
REV3
YPL167C
4515 nt
2
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
AHC2
YCR082W
387 nt
2
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
YNR025C
YNR025C
360 nt
2
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
YPR096C
YPR096C
303 nt
2
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
BRO1
YPL084W
2535 nt
2
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
DIS3
YOL021C
3006 nt
2
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
IST2
YBR086C
2841 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
RTP1
YMR185W
2946 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
NCL1
YBL024W
2055 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
PEA2
YER149C
1263 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
YER175W-A
YER175W-A
165 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
YGL014C-A
YGL014C-A
162 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
PEP8
YJL053W
1140 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
YHC1
YLR298C
696 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
YLR379W
YLR379W
375 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
DPB11
YJL090C
2295 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
COS111
YBR203W
2775 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
VPS34
YLR240W
2628 nt
1.99
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
DAD4
YDR320C-A
219 nt
1.98
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
IRC4
YDR540C
540 nt
1.98
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
TPM2
YIL138C
486 nt
1.98
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
YIR020C
YIR020C
303 nt
1.98
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
YLR252W
YLR252W
306 nt
1.98
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
ATX2
YOR079C
942 nt
1.98
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
GIP3
YPL137C
3831 nt
1.98
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
YJL016W
YJL016W
1686 nt
1.97
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
USO1
YDL058W
5373 nt
1.97
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
RPL40A
YIL148W
387 nt
1.97
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
SWS2
YNL081C
432 nt
1.97
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
YOR105W
YOR105W
327 nt
1.97
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
snR189
snR189
189 nt
1.97
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
YMR045C
YMR045C
5268 nt
1.97
□□□□□ -2.09
CKI1
P20485
MYO2
YOR326W
4725 nt
1.96
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
YDL025W-A
YDL025W-A
105 nt
1.96
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
YIL029C
YIL029C
429 nt
1.96
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
YIL030W-A
YIL030W-A
339 nt
1.96
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
AFB1
YLR040C
675 nt
1.96
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
YNL146C-A
YNL146C-A
195 nt
1.96
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
LSM7
YNL147W
348 nt
1.96
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
TOA1
YOR194C
861 nt
1.96
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
YPL039W
YPL039W
951 nt
1.96
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
MMS22
YLR320W
4365 nt
1.96
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
NAN1
YPL126W
2691 nt
1.95
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
CDC50
YCR094W
1176 nt
1.95
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
RNR4
YGR180C
1038 nt
1.95
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
SPO13
YHR014W
876 nt
1.95
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
CMS1
YLR003C
876 nt
1.95
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
LCL2
YLR104W
396 nt
1.95
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
RPL37A
YLR185W
267 nt
1.95
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
YBL108W
YBL108W
306 nt
1.95
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
RBL2
YOR265W
321 nt
1.95
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
NIC96
YFR002W
2520 nt
1.95
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
MPH1
YIR002C
2982 nt
1.95
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
MET18
YIL128W
3099 nt
1.94
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
VPH1
YOR270C
2523 nt
1.94
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
CRD1
YDL142C
852 nt
1.94
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
CAJ1
YER048C
1176 nt
1.94
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
TIM10
YHR005C-A
282 nt
1.94
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
MSL1
YIR009W
336 nt
1.94
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
CCW14
YLR390W-A
717 nt
1.94
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
URA10
YMR271C
684 nt
1.94
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
MDM32
YOR147W
1869 nt
1.94
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
GCN2
YDR283C
4980 nt
1.94
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
IRC10
YOL015W
1761 nt
1.93
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
PEP1
YBL017C
4740 nt
1.93
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
SPC1
YJR010C-A
285 nt
1.93
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
SNC1
YAL030W
354 nt
1.93
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
TMA10
YLR327C
261 nt
1.93
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
RPB11
YOL005C
363 nt
1.93
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
TRL1
YJL087C
2484 nt
1.93
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
CDC53
YDL132W
2448 nt
1.92
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
UBC5
YDR059C
447 nt
1.92
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
MZM1
YDR493W
372 nt
1.92
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
NOP10
YHR072W-A
177 nt
1.92
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
YOR392W
YOR392W
444 nt
1.92
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
AGC1
YPR021C
2709 nt
1.92
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
LRE1
YCL051W
1752 nt
1.92
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
SPE1
YKL184W
1401 nt
1.91
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
HNT1
YDL125C
477 nt
1.91
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
YLR271W
YLR271W
825 nt
1.91
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
ICY1
YMR195W
384 nt
1.91
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
YMR272W-B
YMR272W-B
108 nt
1.91
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
YNL010W
YNL010W
726 nt
1.91
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
RPS7B
YNL096C
573 nt
1.91
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
YOR333C
YOR333C
417 nt
1.91
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
RTT101
YJL047C
2529 nt
1.91
□□□□□ -2.1
CKI1
P20485
RTT107
YHR154W
3213 nt
1.9
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
UTP13
YLR222C
2454 nt
1.9
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
YDR029W
YDR029W
315 nt
1.9
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
YDR220C
YDR220C
294 nt
1.9
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
YJL127C-B
YJL127C-B
159 nt
1.9
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
BER1
YLR412W
825 nt
1.9
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
PHO80
YOL001W
882 nt
1.9
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
YPR172W
YPR172W
603 nt
1.9
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
BFA1
YJR053W
1725 nt
1.9
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
YOR343W-A
YOR343W-A
1317 nt
1.9
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
BUD2
YKL092C
3315 nt
1.89
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
RUD3
YOR216C
1455 nt
1.89
□□□□□ -2.11
CKI1
P20485
MNE1
YOR350C
1992 nt
1.89
□□□□□ -2.11
First
Previous
60
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.5 ms