Protein–RNA interactions for Protein: P16550

APA1, Protein APA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APA1P16550 YER138CYER138C 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YER160CYER160C 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YJR027WYJR027W 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YML039WYML039W 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YML045WYML045W 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YMR050CYMR050C 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 TFC4YGR047C 3078 nt2.65□□□□□ -1.98
APA1P16550 MSS11YMR164C 2277 nt2.65□□□□□ -1.99
APA1P16550 JIP3YLR331C 378 nt2.65□□□□□ -1.99
APA1P16550 PEX17YNL214W 600 nt2.65□□□□□ -1.99
APA1P16550 FYV12YOR183W 390 nt2.65□□□□□ -1.99
APA1P16550 LCL1YPL056C 306 nt2.65□□□□□ -1.99
APA1P16550 BUB1YGR188C 3066 nt2.65□□□□□ -1.99
APA1P16550 PFF1YBR074W 2931 nt2.65□□□□□ -1.99
APA1P16550 CYR1YJL005W 6081 nt2.64□□□□□ -1.99
APA1P16550 GET1YGL020C 708 nt2.64□□□□□ -1.99
APA1P16550 RUF22RUF22 515 nt2.64□□□□□ -1.99
APA1P16550 TOM22YNL131W 459 nt2.64□□□□□ -1.99
APA1P16550 YBR277CYBR277C 402 nt2.64□□□□□ -1.99
APA1P16550 GDS1YOR355W 1569 nt2.64□□□□□ -1.99
APA1P16550 ECM29YHL030W 5607 nt2.64□□□□□ -1.99
APA1P16550 snR70snR70 164 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 MSL1YIR009W 336 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 SHE2YKL130C 741 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 YLR101CYLR101C 396 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 ROX1YPR065W 1107 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 RPB5YBR154C 648 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 PRK1YIL095W 2433 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 RPO41YFL036W 4056 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 TAE2YPL009C 3117 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 YJL181WYJL181W 1836 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 YDR239CYDR239C 2364 nt2.63□□□□□ -1.99
APA1P16550 GIN4YDR507C 3429 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 CDC50YCR094W 1176 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 VOA1YGR106C 798 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 YJR157WYJR157W 363 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 IRC19YLL033W 693 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 CMC2YBL059C-A 330 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 snR13snR13 124 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 YPR039WYPR039W 336 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 CDC20YGL116W 1833 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 RTT10YPL183C 3042 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 FKS3YMR306W 5358 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 SEC26YDR238C 2922 nt2.62□□□□□ -1.99
APA1P16550 YIL174WYIL174W 228 nt2.61□□□□□ -1.99
APA1P16550 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.61□□□□□ -1.99
APA1P16550 ACM1YPL267W 630 nt2.61□□□□□ -1.99
APA1P16550 MPH1YIR002C 2982 nt2.61□□□□□ -1.99
APA1P16550 NIC96YFR002W 2520 nt2.61□□□□□ -1.99
APA1P16550 AFI1YOR129C 2682 nt2.6□□□□□ -1.99
APA1P16550 YDR250CYDR250C 276 nt2.6□□□□□ -1.99
APA1P16550 YLR269CYLR269C 351 nt2.6□□□□□ -1.99
APA1P16550 CRM1YGR218W 3255 nt2.6□□□□□ -1.99
APA1P16550 PDR3YBL005W 2931 nt2.59□□□□□ -1.99
APA1P16550 NCE101YJL205C 162 nt2.59□□□□□ -1.99
APA1P16550 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.59□□□□□ -1.99
APA1P16550 YPR177CYPR177C 372 nt2.59□□□□□ -1.99
APA1P16550 AXL1YPR122W 3627 nt2.59□□□□□ -2
APA1P16550 UBP15YMR304W 3693 nt2.59□□□□□ -2
APA1P16550 MMS1YPR164W 4224 nt2.59□□□□□ -2
APA1P16550 NAN1YPL126W 2691 nt2.58□□□□□ -2
APA1P16550 PTP3YER075C 2787 nt2.58□□□□□ -2
APA1P16550 IES5YER092W 378 nt2.58□□□□□ -2
APA1P16550 BET3YKR068C 582 nt2.58□□□□□ -2
APA1P16550 GRX8YLR364W 330 nt2.58□□□□□ -2
APA1P16550 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.58□□□□□ -2
APA1P16550 YMR320WYMR320W 306 nt2.58□□□□□ -2
APA1P16550 LSM7YNL147W 348 nt2.58□□□□□ -2
APA1P16550 YBR032WYBR032W 303 nt2.58□□□□□ -2
APA1P16550 RRP12YPL012W 3687 nt2.58□□□□□ -2
APA1P16550 SEC7YDR170C 6030 nt2.58□□□□□ -2
APA1P16550 PHO91YNR013C 2685 nt2.57□□□□□ -2
APA1P16550 ESL2YKR096W 3588 nt2.57□□□□□ -2
APA1P16550 SRO77YBL106C 3033 nt2.57□□□□□ -2
APA1P16550 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.57□□□□□ -2
APA1P16550 YGR025WYGR025W 303 nt2.57□□□□□ -2
APA1P16550 RPL14BYHL001W 417 nt2.57□□□□□ -2
APA1P16550 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.57□□□□□ -2
APA1P16550 YLR031WYLR031W 561 nt2.57□□□□□ -2
APA1P16550 RRT1YBL048W 312 nt2.57□□□□□ -2
APA1P16550 ATP3YBR039W 936 nt2.57□□□□□ -2
APA1P16550 VPS52YDR484W 1926 nt2.57□□□□□ -2
APA1P16550 IRC10YOL015W 1761 nt2.56□□□□□ -2
APA1P16550 RIC1YLR039C 3171 nt2.56□□□□□ -2
APA1P16550 NAB6YML117W 3405 nt2.56□□□□□ -2
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