Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LAD1O00515 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAD1O00515 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAD1O00515 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAD1O00515 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAD1O00515 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAD1O00515 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAD1O00515 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAD1O00515 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAD1O00515 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAD1O00515 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAD1O00515 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAD1O00515 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAD1O00515 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAD1O00515 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LAD1O00515 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAD1O00515 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAD1O00515 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAD1O00515 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAD1O00515 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAD1O00515 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAD1O00515 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAD1O00515 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAD1O00515 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAD1O00515 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAD1O00515 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LAD1O00515 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAD1O00515 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAD1O00515 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms