Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARID3CA6NKF2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms