Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SOX13Q9UN79 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX13Q9UN79 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX13Q9UN79 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX13Q9UN79 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX13Q9UN79 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms