Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF346Q9UL40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF346Q9UL40 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF346Q9UL40 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF346Q9UL40 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF346Q9UL40 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms