Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC3Q9BY71 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC3Q9BY71 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC3Q9BY71 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC3Q9BY71 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC3Q9BY71 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC3Q9BY71 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC3Q9BY71 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC3Q9BY71 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC3Q9BY71 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC3Q9BY71 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC3Q9BY71 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC3Q9BY71 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC3Q9BY71 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC3Q9BY71 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms