Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SELENOOQ9BVL4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SELENOOQ9BVL4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SELENOOQ9BVL4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SELENOOQ9BVL4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SELENOOQ9BVL4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms