Protein–RNA interactions for Protein: Q96A99

PTX4, Pentraxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4Q96A99 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTX4Q96A99 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX4Q96A99 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX4Q96A99 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX4Q96A99 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTX4Q96A99 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTX4Q96A99 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX4Q96A99 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTX4Q96A99 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX4Q96A99 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX4Q96A99 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTX4Q96A99 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTX4Q96A99 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTX4Q96A99 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTX4Q96A99 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTX4Q96A99 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTX4Q96A99 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTX4Q96A99 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTX4Q96A99 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTX4Q96A99 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms